R read.table读取数据中的困惑
2017-04-20 12:34
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一·read.table()
下面为GEO数据库里的样本数据：
gen<-read.table("GSE69395_series_matrix - 副本.txt",header = T,sep = "\t")
之后显示里面数据是：factor。之后做fold-change校正的时候，报错，不是数值型~~~
于是 ：---------
gen<-read.table("GSE69395_series_matrix - 副本.txt",header = F,sep = "\t",stringsAsFactors =F)
默认不是因子型，才可以。
随后又发现
gen<-read.table("GSE69395_series_matrix - 副本.txt",header = T,sep = "\t",row.names = 1)
当row.names为1时候，第一列可成为行名，数据也是数值型
二、
1.rm(list = ls()) ##删除所有变量
2.object.size() ##查看该变量占内存空间大小
下面为GEO数据库里的样本数据：
gen<-read.table("GSE69395_series_matrix - 副本.txt",header = T,sep = "\t")
之后显示里面数据是：factor。之后做fold-change校正的时候，报错，不是数值型~~~
于是 ：---------
gen<-read.table("GSE69395_series_matrix - 副本.txt",header = F,sep = "\t",stringsAsFactors =F)
默认不是因子型，才可以。
随后又发现
gen<-read.table("GSE69395_series_matrix - 副本.txt",header = T,sep = "\t",row.names = 1)
当row.names为1时候，第一列可成为行名，数据也是数值型
二、
1.rm(list = ls()) ##删除所有变量
2.object.size() ##查看该变量占内存空间大小
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