【转】Linux安装HDF5及遇到的问题总结
2017-11-03 11:37
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Linux安装HDF5及遇到的问题总结
转自： http://www.linuxdiyf.com/linux/26164.html| ubuntu版本：16.04.2 64位 从HDF官网（https://support.hdfgroup.org/HDF5/）上下载hdf5-1.8.17.tar.gz  简要安装步骤如下：（详细步骤：hdf5-1.8.17/release_docs/INSTALL） $ gunzip < hdf5-X.Y.Z.tar.gz | tar xf - #解压缩 $ cd hdf5-X.Y.Z $ ./configure --prefix=/usr/local/hdf5 #安装路径 $ make $ make check # run test suite. $ make install $ make check-install # verify installation. 注：X.Y.Z是HDF版本 安装成功后，在安装目录/usr/local下出现hdf5文件夹，打开后  在/share/hdf5_examples/下是示例程序。打开c文件夹，下面我们来测试。该文件夹下有个名为run-c-ex.sh文件，执行该文件可以将c目录下所有.c文件执行。  运行命令：$ sudo ./run-c-ex.sh 即可得到所有文件的执行结果。 打开run-c-ex.sh文件可查看该文件内容如下  下面我们来讲怎么执行单个.c文件，以/usr/local/hdf5/share/hdf5_examples/c目录下h5_extend.c为例 执行 $ sudo h5cc -o h5_extend h5_extend.c  可是却报出错误：h5cc:command not found 我们在命令行输入h5cc，可以看到  提示我们h5cc没有安装，按照指示，我们输入sudo apt install hdf5-helpers  接下来再执行，却报出hdf5.h: No such file or directory的错误  只要安装libhdf5-serial-dev就可以了。 执行命令：$ sudo apt-get install libhdf5-serial-dev  再次执行 $ sudo h5cc -o h5_extend h5_extend.c 没有问题，执行：$ ./h5_extend  在/share/hdf5_examples/c目录下除了生成h5_extend和h5_extend.o两个文件，还有extend.h5文件。   下面介绍一个可视化工具HDFView，它可以用来查看和编辑HDF文件。（https://support.hdfgroup.org/products/Java/hdfview/） 下载HDFView，即可查看我们刚刚得到的extend.h5  本文永久更新地址：http://www.linuxdiyf.com/linux/26164.html |
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