如何根据SRA accession number 从NCBI下载数据
2018-01-29 17:25
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根据 accession number从NCBI下载FASTQ/FASTA格式的测序数据(pig)
1. 打开NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/),输入accession number搜索,我查阅一些文献是关于通城猪的(SRX510749
)(Li X, et al. 2014. Genome-wide scans to detect positive selection in Large White and Tongcheng pigs. Anim Genet. 45(3):329–339 )。
我直接点击Download data 时出现下载不了的状况,不知道是不是网络原因。
2.因此返回点击进入tongcheng_pool,出现如下界面,这里是这个数据的具体信息。
3.点击进入其中一个run,
4.进入上面一栏的Download--FASTA/FASTQ,
5.输入刚才的number (SRX510749 )搜索,
6.选择数据及数据格式点击右面的Download 进行下载。
1. 打开NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/),输入accession number搜索,我查阅一些文献是关于通城猪的(SRX510749
)(Li X, et al. 2014. Genome-wide scans to detect positive selection in Large White and Tongcheng pigs. Anim Genet. 45(3):329–339 )。
我直接点击Download data 时出现下载不了的状况,不知道是不是网络原因。
2.因此返回点击进入tongcheng_pool,出现如下界面,这里是这个数据的具体信息。
3.点击进入其中一个run,
4.进入上面一栏的Download--FASTA/FASTQ,
5.输入刚才的number (SRX510749 )搜索,
6.选择数据及数据格式点击右面的Download 进行下载。
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