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深度学习之Python的科学计算包 – Numpy

2017-10-28 14:22 851 查看
umpy(Numerical Python extensions)是一个第三方的Python包,用于科学计算。这个库的前身是1995年就开始开发的一个用于数组运算的库。经过了长时间的发展,基本上成了绝大部分Python科学计算的基础包,当然也包括所有提供Python接口的深度学习框架。

numpy在Linux下的安装已经在5.1.2中作为例子讲过,Windows下也可以通过pip,或者到下面网址下载:

Obtaining
NumPy & SciPy libraries


5.3.1 基本类型(array)

array,也就是数组,是numpy中最基础的数据结构,最关键的属性是维度和元素类型,在numpy中,可以非常方便地创建各种不同类型的多维数组,并且执行一些基本基本操作,来看例子:

Python

123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142import numpy as np a = [1, 2, 3, 4] #b = np.array(a) # array([1, 2, 3, 4])type(b) # <type 'numpy.ndarray'> b.shape # (4,)b.argmax() # 3b.max() # 4b.mean() # 2.5 c = [[1, 2], [3, 4]] # 二维列表d = np.array(c) # 二维numpy数组d.shape # (2, 2)d.size # 4d.max(axis=0) # 找维度0,也就是最后一个维度上的最大值,array([3, 4])d.max(axis=1) # 找维度1,也就是倒数第二个维度上的最大值,array([2, 4])d.mean(axis=0) # 找维度0,也就是第一个维度上的均值,array([ 2., 3.])d.flatten() # 展开一个numpy数组为1维数组,array([1, 2, 3, 4])np.ravel(c) # 展开一个可以解析的结构为1维数组,array([1, 2, 3, 4]) # 3x3的浮点型2维数组,并且初始化所有元素值为1e = np.ones((3, 3), dtype=np.float) # 创建一个一维数组,元素值是把3重复4次,array([3, 3, 3, 3])f = np.repeat(3, 4) # 2x2x3的无符号8位整型3维数组,并且初始化所有元素值为0g = np.zeros((2, 2, 3), dtype=np.uint8)g.shape # (2, 2, 3)h = g.astype(np.float) # 用另一种类型表示 l = np.arange(10) # 类似range,array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9])m = np.linspace(0, 6, 5)# 等差数列,0到6之间5个取值,array([ 0., 1.5, 3., 4.5, 6.]) p = np.array( [[1, 2, 3, 4], [5, 6, 7, 8]]) np.save('p.npy', p) # 保存到文件q = np.load('p.npy') # 从文件读取
注意到在导入numpy的时候,我们将np作为numpy的别名。这是一种习惯性的用法,后面的章节中我们也默认这么使用。作为一种多维数组结构,array的数组相关操作是非常丰富的:Python

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import
numpy
as
np

'''

array([[[ 0, 1, 2, 3],

[ 4, 5, 6, 7],

[ 8, 9, 10, 11]],

[[12, 13, 14, 15],

[16, 17, 18, 19],

[20, 21, 22, 23]]])

'''

a
=
np.arange(24).reshape((2,
3,
4))

b
=
a[1][1][1] #
17

'''

array([[ 8, 9, 10, 11],

[20, 21, 22, 23]])

'''

c
=
a[:,
2,
:]

''' 用:表示当前维度上所有下标

array([[ 1, 5, 9],

[13, 17, 21]])

'''

d
=
a[:,
:,
1]

''' 用...表示没有明确指出的维度

array([[ 1, 5, 9],

[13, 17, 21]])

'''

e
=
a[...,
1]

'''

array([[[ 5, 6],

[ 9, 10]],

[[17, 18],

[21, 22]]])

'''

f
=
a[:,
1:,
1:-1]

'''

平均分成3份

[array([0, 1, 2]), array([3, 4,
5]), array([6, 7, 8])]

'''

g
=
np.split(np.arange(9),
3)

'''

按照下标位置进行划分

[array([0, 1]), array([2, 3, 4,
5]), array([6, 7, 8])]

'''

h
=
np.split(np.arange(9),
[2,
-3])

l0
=
np.arange(6).reshape((2,
3))

l1
=
np.arange(6,
12).reshape((2,
3))

'''

vstack是指沿着纵轴拼接两个array,vertical

hstack是指沿着横轴拼接两个array,horizontal

更广义的拼接用concatenate实现,horizontal后的两句依次等效于vstack和hstack

stack不是拼接而是在输入array的基础上增加一个新的维度

'''

m
=
np.vstack((l0,
l1))

p
=
np.hstack((l0,
l1))

q
=
np.concatenate((l0,
l1))

r
=
np.concatenate((l0,
l1),
axis=-1)

s
=
np.stack((l0,
l1))

'''

按指定轴进行转置

array([[[ 0, 3],

[ 6, 9]],

[[ 1, 4],

[ 7, 10]],

[[ 2, 5],

[ 8, 11]]])

'''

t
=
s.transpose((2,
0,
1))

'''

默认转置将维度倒序,对于2维就是横纵轴互换

array([[ 0, 4, 8],

[ 1, 5, 9],

[ 2, 6, 10],

[ 3, 7, 11]])

'''

u
=
a[0].transpose()
#
或者u=a[0].T也是获得转置

'''

逆时针旋转90度,第二个参数是旋转次数

array([[ 3, 2, 1, 0],

[ 7, 6, 5, 4],

[11, 10, 9, 8]])

'''

v
=
np.rot90(u,
3)

'''

沿纵轴左右翻转

array([[ 8, 4, 0],

[ 9, 5, 1],

[10, 6, 2],

[11, 7, 3]])

'''

w
=
np.fliplr(u)

'''

沿水平轴上下翻转

array([[ 3, 7, 11],

[ 2, 6, 10],

[ 1, 5, 9],

[ 0, 4, 8]])

'''

x
=
np.flipud(u)

'''

按照一维顺序滚动位移

array([[11, 0, 4],

[ 8, 1, 5],

[ 9, 2, 6],

[10, 3, 7]])

'''

y
=
np.roll(u,
1)

'''

按照指定轴滚动位移

array([[ 8, 0, 4],

[ 9, 1, 5],

[10, 2, 6],

[11, 3, 7]])

'''

z
=
np.roll(u,
1,
axis=1)

对于一维的array所有Python列表支持的下标相关的方法array也都支持,所以在此没有特别列出。

既然叫numerical python,基础数学运算也是强大的:

Python

12345678910111213141516171819202122232425262728293031import numpy as np # 绝对值,1a = np.abs(-1) # sin函数,1.0b = np.sin(np.pi/2) # tanh逆函数,0.50000107157840523c = np.arctanh(0.462118) # e为底的指数函数,20.085536923187668d = np.exp(3) # 2的3次方,8f = np.power(2, 3) # 点积,1*3+2*4=11g = np.dot([1, 2], [3, 4]) # 开方,5h = np.sqrt(25) # 求和,10l = np.sum([1, 2, 3, 4]) # 平均值,5.5m = np.mean([4, 5, 6, 7]) # 标准差,0.96824583655185426p = np.std([1, 2, 3, 2, 1, 3, 2, 0])
对于array,默认执行对位运算。涉及到多个array的对位运算需要array的维度一致,如果一个array的维度和另一个array的子维度一致,则在没有对齐的维度上分别执行对位运算,这种机制叫做广播(broadcasting),言语解释比较难,还是看例子理解:Python

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import
numpy
as
np

a
=
np.array([

[1,
2,
3],

[4,
5,
6]

])

b
=
np.array([

[1,
2,
3],

[1,
2,
3]

])

'''

维度一样的array,对位计算

array([[2, 4, 6],

[5, 7, 9]])

'''

a
+
b

'''

array([[0, 0, 0],

[3, 3, 3]])

'''

a
-
b

'''

array([[ 1, 4, 9],

[ 4, 10, 18]])

'''

a
*
b

'''

array([[1, 1, 1],

[4, 2, 2]])

'''

a
/
b

'''

array([[ 1, 4, 9],

[16, 25, 36]])

'''

a
**
2

'''

array([[ 1, 4, 27],

[ 4, 25, 216]])

'''

a
**
b

c
=
np.array([

[1,
2,
3],

[4,
5,
6],

[7,
8,
9],

[10,
11,
12]

])

d
=
np.array([2,
2,
2])

'''

广播机制让计算的表达式保持简洁

d和c的每一行分别进行运算

array([[ 3, 4, 5],

[ 6, 7, 8],

[ 9, 10, 11],

[12, 13, 14]])

'''

c
+
d

'''

array([[ 2, 4, 6],

[ 8, 10, 12],

[14, 16, 18],

[20, 22, 24]])

'''

c
*
d

'''

1和c的每个元素分别进行运算

array([[ 0, 1, 2],

[ 3, 4, 5],

[ 6, 7, 8],

[ 9, 10, 11]])

'''

c
-
1


5.3.2 线性代数模块(linalg)

在深度学习相关的数据处理和运算中,线性代数模块(linalg)是最常用的之一。结合numpy提供的基本函数,可以对向量,矩阵,或是说多维张量进行一些基本的运算:

Python

12345678910111213141516171819202122232425262728293031323334353637383940414243444546474849505152535455565758596061626364import numpy as np a = np.array([3, 4])np.linalg.norm(a) b = np.array([ [1, 2, 3], [4, 5, 6], [7, 8, 9]])c = np.array([1, 0, 1]) # 矩阵和向量之间的乘法np.dot(b, c) # array([ 4, 10, 16])np.dot(c, b.T) # array([ 4, 10, 16]) np.trace(b) # 求矩阵的迹,15np.linalg.det(b) # 求矩阵的行列式值,0np.linalg.matrix_rank(b) # 求矩阵的秩,2,不满秩,因为行与行之间等差 d = np.array([ [2, 1], [1, 2]]) '''对正定矩阵求本征值和本征向量本征值为u,array([ 3., 1.])本征向量构成的二维array为v,array([[ 0.70710678, -0.70710678], [ 0.70710678, 0.70710678]])是沿着45°方向eig()是一般情况的本征值分解,对于更常见的对称实数矩阵,eigh()更快且更稳定,不过输出的值的顺序和eig()是相反的'''u, v = np.linalg.eig(d) # Cholesky分解并重建l = np.linalg.cholesky(d) '''array([[ 2., 1.], [ 1., 2.]])'''np.dot(l, l.T) e = np.array([ [1, 2], [3, 4]]) # 对不镇定矩阵,进行SVD分解并重建U, s, V = np.linalg.svd(e) S = np.array([ [s[0], 0], [0, s[1]]]) '''array([[ 1., 2.], [ 3., 4.]])'''np.dot(U, np.dot(S, V))

5.3.3 随机模块(random)

随机模块包含了随机数产生和统计分布相关的基本函数,Python本身也有随机模块random,不过功能更丰富,还是来看例子:Python

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import
numpy
as
np

import
numpy.random
as
random

#
设置随机数种子

random.seed(42)

#
产生一个1x3,[0,1)之间的浮点型随机数

#
array([[ 0.37454012, 0.95071431, 0.73199394]])

#
后面的例子就不在注释中给出具体结果了

random.rand(1,
3)

#
产生一个[0,1)之间的浮点型随机数

random.random()

#
下边4个没有区别,都是按照指定大小产生[0,1)之间的浮点型随机数array,不Pythonic…

random.random((3,
3))

random.sample((3,
3))

random.random_sample((3,
3))

random.ranf((3,
3))

#
产生10个[1,6)之间的浮点型随机数

5*random.random(10)
+
1

random.uniform(1,
6,
10)

#
产生10个[1,6]之间的整型随机数

random.randint(1,
6,
10)

#
产生2x5的标准正态分布样本

random.normal(size=(5,
2))

#
产生5个,n=5,p=0.5的二项分布样本

random.binomial(n=5,
p=0.5,
size=5)

a
=
np.arange(10)

#
从a中有回放的随机采样7个

random.choice(a,
7)

#
从a中无回放的随机采样7个

random.choice(a,
7,
replace=False)

#
对a进行乱序并返回一个新的array

b
=
random.permutation(a)

#
对a进行in-place乱序

random.shuffle(a)

#
生成一个长度为9的随机bytes序列并作为str返回

#
'\x96\x9d\xd1?\xe6\x18\xbb\x9a\xec'

random.bytes(9)

随机模块可以很方便地让我们做一些快速模拟去验证一些结论。比如来考虑一个非常违反直觉的概率题例子:一个选手去参加一个TV秀,有三扇门,其中一扇门后有奖品,这扇门只有主持人知道。选手先随机选一扇门,但并不打开,主持人看到后,会打开其余两扇门中没有奖品的一扇门。然后,主持人问选手,是否要改变一开始的选择?

这个问题的答案是应该改变一开始的选择。在第一次选择的时候,选错的概率是2/3,选对的概率是1/3。第一次选择之后,主持人相当于帮忙剔除了一个错误答案,所以如果一开始选的是错的,这时候换掉就选对了;而如果一开始就选对,则这时候换掉就错了。根据以上,一开始选错的概率就是换掉之后选对的概率(2/3),这个概率大于一开始就选对的概率(1/3),所以应该换。虽然道理上是这样,但是还是有些绕,要是通过推理就是搞不明白怎么办,没关系,用随机模拟就可以轻松得到答案:

Python

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import
numpy.random
as
random

random.seed(42)

#
做10000次实验

n_tests
=
10000

#
生成每次实验的奖品所在的门的编号

#
0表示第一扇门,1表示第二扇门,2表示第三扇门

winning_doors
=
random.randint(0,
3,
n_tests)

#
记录如果换门的中奖次数

change_mind_wins
=
0

#
记录如果坚持的中奖次数

insist_wins
=
0

#
winning_door就是获胜门的编号

for
winning_door
in
winning_doors:

#
随机挑了一扇门

first_try
=
random.randint(0,
3)

#
其他门的编号

remaining_choices
=
[i
for
i
in
range(3)
if
i
!=
first_try]

#
没有奖品的门的编号,这个信息只有主持人知道

wrong_choices
=
[i
for
i
in
range(3)
if
i
!=
winning_door]

#
一开始选择的门主持人没法打开,所以从主持人可以打开的门中剔除

if
first_try
in
wrong_choices:

wrong_choices.remove(first_try)

#
这时wrong_choices变量就是主持人可以打开的门的编号

#
注意此时如果一开始选择正确,则可以打开的门是两扇,主持人随便开一扇门

#
如果一开始选到了空门,则主持人只能打开剩下一扇空门

screened_out
=
random.choice(wrong_choices)

remaining_choices.remove(screened_out)

#
所以虽然代码写了好些行,如果策略固定的话,

#
改变主意的获胜概率就是一开始选错的概率,是2/3

#
而坚持选择的获胜概率就是一开始就选对的概率,是1/3

#
现在除了一开始选择的编号,和主持人帮助剔除的错误编号,只剩下一扇门

#
如果要改变注意则这扇门就是最终的选择

changed_mind_try
=
remaining_choices[0]

#
结果揭晓,记录下来

change_mind_wins
+=
1
if
changed_mind_try
==
winning_door
else
0

insist_wins
+=
1
if
first_try
==
winning_door
else
0

#
输出10000次测试的最终结果,和推导的结果差不多:

#
You win 6616 out of 10000 tests if you changed your mind

#
You win 3384 out of 10000 tests if you insist on the initial choice

print(

'You
win {1} out of {0} tests if you changed your mind\n'

'You
win {2} out of {0} tests if you insist on the initial choice'.format(

n_tests,
change_mind_wins,
insist_wins

)

)

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