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中国科学院分子影像重点实验室田捷研究员团队自主研发的三维医学图像处理及分析平台3DMed更新到第五版

2017-08-04 13:56 671 查看
中国科学院分子影像重点实验室田捷研究员团队自主研发的三维医学图像处理及分析平台3DMed更新到第五版

2017-08-01  中国科学院分子影像重点实验室
中国科学院分子影像重点实验室经过长期的医疗影像大数据关键技术的积累,自主开发了集成化、跨平台和接口规范的医学影像处理与分析C++类库MITK,并为其编写了一套人机交互界面“三维医学图像处理及分析系统(3DMed)”。在设计上,3DMed由一组定义接口的核心模块和众多松散耦合在一起的插件组成,这使得3DMed也可以给用户自定义算法提供交互。
随着实验室的不断发展壮大,3DMed软件架构逐渐完善和它的插件也逐渐丰富,功能涵盖了从数据采集、数据格式转换、面绘制、体绘制、图像分割、图像配准、三维图像处理、三维虚拟切割和三维测量等。最初,我们开发的3DMed 1.x提供图形界面的同时提供算法的实现;在3DMed
2.x版中,我们优化了软件架构,将
4000
算法部分单独实现形成MITK,3DMed只负责前台界面部分并采用QT3进行界面设计,至此3DMed能够通过插件机制不断集成新的功能;随着MITK算法库更新到2.x版,3DMed
3.x版提供了更稳定的接口和引入了对大数据的支持;为了适应计算硬件的快速发展,MITK算法库添加了并行运算模块,3DMed 4.x的编译环境也迁移到QT4并开源代码,且插件接口(Plugin
SDK)被重新设计,使得扩展机制更为灵活、用户界面更加人性和运行任务更加高效;近期,3DMed发布了5.0版本,编译环境由4.0版的QT4迁移到QT5,在兼容前一版本的插件接口的基础上提供了新的插件接口,并优化了对高版本显卡的支持。由于3DMed的实用、简洁和高效,而被生物医学工程领域主流期刊上的第三方评论文章(Medical
andBiological Engineering and Computing 2008, 46(12):1209-17.) 经由9大类64个指标评为医学图像处理软件全球前十,并获得院科发局科技服务网络计划(STS计划:KFJ-SW-STS-160)的支持。
随着人工智能和影像组学(Radiomics)的快速发展,我们将会在3DMed 5.x软件平台中增加具有网络功能的插件接口,以实现对Radiomics算法库的支持。时代在进步,MITK/3DMed也在发展,但它的实用、简洁和高效永远不变。如果您是MITK/3DMed的使用者,我们欢迎您访问www.3dmed.net网站下载和使用。如果您是MITK/3DMed的爱好者,我们欢迎您访问www.mitk.net下载源码,我们也希望您能发邮件到mitk@fingerpass.net.cn反馈使用过程中遇到的问题。如果您是MITK/3DMed的支持者,欢迎您基于Plugin
SDK开发自己的插件,并希望您能够上传自定义插件的信息到www.casmi.science



图1 开源的医学影像应用平台3DMed主界面
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