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EM算法求高斯混合模型參数预计——Python实现

2017-04-19 09:43 344 查看

EM算法一般表述:

当有部分数据缺失或者无法观察到时,EM算法提供了一个高效的迭代程序用来计算这些数据的最大似然预计。在每一步迭代分为两个步骤:期望(Expectation)步骤和最大化(Maximization)步骤,因此称为EM算法。

如果所有数据Z是由可观測到的样本X={X1, X2,……, Xn}和不可观測到的样本Z={Z1, Z2,……, Zn}组成的,则Y = X∪Z。EM算法通过搜寻使所有数据的似然函数Log(L(Z; h))的期望值最大来寻找极大似然预计,注意此处的h不是一个变量,而是多个变量组成的參数集合。此期望值是在Z所遵循的概率分布上计算,此分布由未知參数h确定。然而Z所遵循的分布是未知的。EM算法使用其当前的如果h`取代实际參数h,以预计Z的分布。

Q( h`| h) = E [ ln P(Y|h`) | h, X ]

EM算法反复下面两个步骤直至收敛。

步骤1:预计(E)步骤:使用当前如果h和观察到的数据X来预计Y上的概率分布以计算Q( h` | h )。

Q( h` | h ) ←E[ ln P(Y|h`) | h, X ]

步骤2:最大化(M)步骤:将如果h替换为使Q函数最大化的如果h`:

h ←argmaxQ( h` | h )

高斯混合模型參数预计问题:

简单起见,本问题研究两个高斯混合模型參数预计k=2。

问题描写叙述:如果X是由k个高斯分布均匀混合而成的,这k个高斯分布的均值不同,可是具有同样的方差。设样本值为x1, x2, ……, xn。xi能够表示为一个K+1元组< xi, zi1, zi2, …, zik>。当中仅仅有一个取1,其余的为0。此处的zi1到zik为隐藏变量。是未知的。且随意zij被选择的概率相等,即

P(zij = 1)=1/k (j=1,2,3.....k)
EM算法求解过程推导例如以下:



Python实现(模拟2个正态分布的均值预计):

#coding:gbk
import math
import copy
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

isdebug = False

# 指定k个高斯分布參数。这里指定k=2。

注意2个高斯分布具有同样均方差Sigma。分别为Mu1,Mu2。

def ini_data(Sigma,Mu1,Mu2,k,N):
global X
global Mu
global Expectations
X = np.zeros((1,N))
Mu = np.random.random(2)
Expectations = np.zeros((N,k))
for i in xrange(0,N):
if np.random.random(1) > 0.5:
X[0,i] = np.random.normal()*Sigma + Mu1
else:
X[0,i] = np.random.normal()*Sigma + Mu2
if isdebug:
print "***********"
print u"初始观測数据X:"
print X
# EM算法:步骤1。计算E[zij]
def e_step(Sigma,k,N):
global Expectations
global Mu
global X
for i in xrange(0,N):
Denom = 0
for j in xrange(0,k):
Denom += math.exp((-1/(2*(float(Sigma**2))))*(float(X[0,i]-Mu[j]))**2)
for j in xrange(0,k):
Numer = math.exp((-1/(2*(float(Sigma**2))))*(float(X[0,i]-Mu[j]))**2)
Expectations[i,j] = Numer / Denom
if isdebug:
print "***********"
print u"隐藏变量E(Z):"
print Expectations
# EM算法:步骤2。求最大化E[zij]的參数Mu
def m_step(k,N):
global Expectations
global X
for j in xrange(0,k):
Numer = 0
Denom = 0
for i in xrange(0,N):
Numer += Expectations[i,j]*X[0,i]
Denom +=Expectations[i,j]
Mu[j] = Numer / Denom
# 算法迭代iter_num次,或达到精度Epsilon停止迭代
def run(Sigma,Mu1,Mu2,k,N,iter_num,Epsilon):
ini_data(Sigma,Mu1,Mu2,k,N)
print u"初始<u1,u2>:", Mu
for i in range(iter_num):
Old_Mu = copy.deepcopy(Mu)
e_step(Sigma,k,N)
m_step(k,N)
print i,Mu
if sum(abs(Mu-Old_Mu)) < Epsilon:
break
if __name__ == '__main__':
run(6,40,20,2,1000,1000,0.0001)
plt.hist(X[0,:],50)
plt.show()

本代码用于模拟k=2个正态分布的均值预计。当中ini_data(Sigma,Mu1,Mu2,k,N)函数用于生成训练样本,此训练样本时从两个高斯分布中随机生成的,当中高斯分布a均值Mu1=40、均方差Sigma=6,高斯分布b均值Mu2=20、均方差Sigma=6,生成的样本分布例如以下图所看到的。因为本问题中实现无法直接冲样本数据中获知两个高斯分布參数。因此须要使用EM算法估算出详细Mu1、Mu2取值。



图 1 样本数据分布

在图1的样本数据下,在第11步时,迭代终止,EM预计结果为:

Mu=[ 40.55261688 19.34252468]

附:

极大似然预计



參考文献:机器学习TomM.Mitchell P.137
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