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Spark技术内幕:Shuffle Read的整体流程

2016-10-16 22:11 288 查看
回忆一下,每个Stage的上边界,要么需要从外部存储读取数据,要么需要读取上一个Stage的输出;而下边界,要么是需要写入本地文件系统(需要Shuffle),以供childStage读取,要么是最后一个Stage,需要输出结果。这里的Stage,在运行时的时候就是可以以pipeline的方式运行的一组Task,除了最后一个Stage对应的是ResultTask,其余的Stage对应的都是ShuffleMap Task。

而除了需要从外部存储读取数据和RDD已经做过cache或者checkpoint的Task,一般Task的开始都是从ShuffledRDD的ShuffleRead开始的。本节将详细讲解Shuffle Read的过程。

先看一下ShuffleRead的整体架构图。



org.apache.Spark.rdd.ShuffledRDD#compute 开始,通过调用org.apache.spark.shuffle.ShuffleManager的getReader方法,获取到org.apache.spark.shuffle.ShuffleReader,然后调用其read()方法进行读取。在Spark1.2.0中,不管是Hash
BasedShuffle或者是Sort BasedShuffle,内置的Shuffle Reader都是 org.apache.spark.shuffle.hash.HashShuffleReader。核心实现:

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 override def read(): Iterator[Product2[K, C]] = {  

val ser =Serializer.getSerializer(dep.serializer)  

// 获取结果  

   val iter = BlockStoreShuffleFetcher.fetch(handle.shuffleId,startPartition, context, ser)  

   // 处理结果  

   val aggregatedIter: Iterator[Product2[K, C]] = if(dep.aggregator.isDefined) {//需要聚合  

     if (dep.mapSideCombine) {//需要map side的聚合  

       new InterruptibleIterator(context, dep.aggregator.get.combineCombinersByKey(  

                            iter, context))  

     } else {//只需要reducer端的聚合  

       new InterruptibleIterator(context,dep.aggregator.get.combineValuesByKey(  

                            iter, context))  

      

}  

    }else { // 无需聚合操作  

       iter.asInstanceOf[Iterator[Product2[K,C]]].map(pair => (pair._1, pair._2))  

    }  

   

   // Sort the output if there is a sort ordering defined.  

   dep.keyOrdering match {//判断是否需要排序  

     case Some(keyOrd: Ordering[K]) => //对于需要排序的情况  

       // 使用ExternalSorter进行排序,注意如果spark.shuffle.spill是false,那么数据是  

       // 不会spill到硬盘的  

       val sorter = new ExternalSorter[K, C, C](ordering = Some(keyOrd),  

                                         serializer= Some(ser))  

       sorter.insertAll(aggregatedIter)  

       context.taskMetrics.memoryBytesSpilled += sorter.memoryBytesSpilled  

       context.taskMetrics.diskBytesSpilled += sorter.diskBytesSpilled  

       sorter.iterator  

     case None => //无需排序  

       aggregatedIter  

    }  

  }  

org.apache.spark.shuffle.hash.BlockStoreShuffleFetcher#fetch会获得数据,它首先会通过

org.apache.spark.MapOutputTracker#getServerStatuses来获得数据的meta信息,这个过程有可能需要向org.apache.spark.MapOutputTrackerMasterActor发送读请求,这个读请求是在org.apache.spark.MapOutputTracker#askTracker发出的。在获得了数据的meta信息后,它会将这些数据存入Seq[(BlockManagerId,Seq[(BlockId, Long)])]中,然后调用org.apache.spark.storage.ShuffleBlockFetcherIterator最终发起请求。ShuffleBlockFetcherIterator根据数据的本地性原则进行数据获取。如果数据在本地,那么会调用org.apache.spark.storage.BlockManager#getBlockData进行本地数据块的读取。而getBlockData对于shuffle类型的数据,会调用ShuffleManager的ShuffleBlockManager的getBlockData。

如果数据在其他的Executor上,那么如果用户使用的spark.shuffle.blockTransferService是netty,那么就会通过org.apache.spark.network.netty.NettyBlockTransferService#fetchBlocks获取;如果使用的是nio,那么就会通过org.apache.spark.network.nio.NioBlockTransferService#fetchBlocks获取。


数据读取策略的划分

org.apache.spark.storage.ShuffleBlockFetcherIterator会通过splitLocalRemoteBlocks划分数据的读取策略:如果在本地有,那么可以直接从BlockManager中获取数据;如果需要从其他的节点上获取,那么需要走网络。由于Shuffle的数据量可能会很大,因此这里的网络读有以下的策略:

1)       每次最多启动5个线程去最多5个节点上读取数据

2)       每次请求的数据大小不会超过spark.reducer.maxMbInFlight(默认值为48MB)/5

这样做的原因有几个:

1)  避免占用目标机器的过多带宽,在千兆网卡为主流的今天,带宽还是比较重要的。如果机器使用的万兆网卡,那么可以通过设置spark.reducer.maxMbInFlight来充分利用带宽。

2)  请求数据可以平行化,这样请求数据的时间可以大大减少。请求数据的总时间就是请求中耗时最长的。这样可以缓解一个节点出现网络拥塞时的影响。

主要的实现:

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private[this] def splitLocalRemoteBlocks():ArrayBuffer[FetchRequest] = {  

   val targetRequestSize = math.max(maxBytesInFlight / 5, 1L)  

   val remoteRequests = new ArrayBuffer[FetchRequest]  

   for ((address, blockInfos) <- blocksByAddress) {  

     if (address.executorId == blockManager.blockManagerId.executorId) {  

       // Block在本地,需要过滤大小为0的block。  

       localBlocks ++= blockInfos.filter(_._2 != 0).map(_._1)  

       numBlocksToFetch += localBlocks.size  

     } else { //需要远程获取的Block  

       val iterator = blockInfos.iterator  

        var curRequestSize = 0L  

       var curBlocks = new ArrayBuffer[(BlockId, Long)]  

       while (iterator.hasNext) {  

          //blockId 是org.apache.spark.storage.ShuffleBlockId,  

          // 格式:"shuffle_" +shuffleId + "_" + mapId + "_" + reduceId  

         val (blockId, size) = iterator.next()  

         // Skip empty blocks  

         if (size > 0) {  

           curBlocks += ((blockId, size))  

           remoteBlocks += blockId  

           numBlocksToFetch += 1  

           curRequestSize += size  

          }  

   

         if (curRequestSize >= targetRequestSize) {  

           // 当前总的size已经可以批量放入一次request中  

           remoteRequests += new FetchRequest(address, curBlocks)  

           curBlocks = new ArrayBuffer[(BlockId, Long)]  

           curRequestSize = 0  

         }  

       }  

       // 剩余的请求组成一次request  

       if (curBlocks.nonEmpty) {  

         remoteRequests += new FetchRequest(address, curBlocks)  

       }  

     }  

    }  

   remoteRequests  

  }  


本地读取

fetchLocalBlocks() 负责本地Block的获取。在splitLocalRemoteBlocks中,已经将本地的Block列表存入了localBlocks:private[this] val localBlocks = newArrayBuffer[BlockId]()

具体过程如下:

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val iter = localBlocks.iterator  

 while (iter.hasNext) {  

   val blockId = iter.next()  

   try {  

     val buf = blockManager.getBlockData(blockId)  

     shuffleMetrics.localBlocksFetched += 1  

     buf.retain()  

     results.put(new SuccessFetchResult(blockId, 0, buf))  

   } catch {  

   }  

  }  

而blockManager.getBlockData(blockId)的实现是:

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override def getBlockData(blockId:BlockId): ManagedBuffer = {  

   if (blockId.isShuffle) {  

    shuffleManager.shuffleBlockManager.getBlockData(blockId.asInstanceOf[ShuffleBlockId])  

}  

这就调用了ShuffleBlockManager的getBlockData方法。在Shuffle Pluggable框架中我们介绍了实现一个Shuffle Service之一就是要实现ShuffleBlockManager。

以Hash BasedShuffle为例,它的ShuffleBlockManager是org.apache.spark.shuffle.FileShuffleBlockManager。FileShuffleBlockManager有两种情况,一种是File consolidate的,这种的话需要根据Map ID和 Reduce ID首先获得FileGroup的一个文件,然后根据在文件中的offset和size来获取需要的数据;如果是没有File consolidate,那么直接根据Shuffle Block
ID直接读取整个文件就可以。

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override def getBlockData(blockId:ShuffleBlockId): ManagedBuffer = {  

   if (consolidateShuffleFiles) {  

     val shuffleState = shuffleStates(blockId.shuffleId)  

     val iter = shuffleState.allFileGroups.iterator  

while(iter.hasNext) {  

  // 根据Map ID和Reduce ID获取File Segment的信息  

       val segmentOpt = iter.next.getFileSegmentFor(blockId.mapId,blockId.reduceId)  

       if (segmentOpt.isDefined) {  

         val segment = segmentOpt.get  

         // 根据File Segment的信息,从FileGroup中找到相应的File和Block在  

          // 文件中的offset和size  

         return new FileSegmentManagedBuffer(  

           transportConf, segment.file, segment.offset, segment.length)  

       }  

     }  

     throw new IllegalStateException("Failed to find shuffle block:" + blockId)  

    }else {  

     val file = blockManager.diskBlockManager.getFile(blockId) //直接获取文件句柄  

     new FileSegmentManagedBuffer(transportConf, file, 0, file.length)  

    }  

  }  

对于Sort BasedShuffle,它需要通过索引文件来获得数据块在数据文件中的具体位置信息,从而读取这个数据。

具体实现在org.apache.spark.shuffle.IndexShuffleBlockManager#getBlockData中。 

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override def getBlockData(blockId: ShuffleBlockId): ManagedBuffer = {  

   // 根据ShuffleID和MapID从org.apache.spark.storage.DiskBlockManager 获取索引文件  

   val indexFile = getIndexFile(blockId.shuffleId, blockId.mapId)  

   val in = new DataInputStream(new FileInputStream(indexFile))  

   try {  

     ByteStreams.skipFully(in, blockId.reduceId * 8) //跳到本次Block的数据区  

     val offset = in.readLong() //数据文件中的开始位置  

     val nextOffset = in.readLong() //数据文件中的结束位置  

     new FileSegmentManagedBuffer(  

       transportConf,  

       getDataFile(blockId.shuffleId, blockId.mapId),  

       offset,  

       nextOffset - offset)  

    }finally {  

     in.close()  

    }  

  }  
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