EMBOSS Linux 下安装使用(needleall)

EMBOSS下载：
http://pan.baidu.com/s/1i4SS5E1
测试文件下载：
http://pan.baidu.com/s/1mihF4xU
1. 解压到目录

2. 执行命令 ./configure 生成Makefile文件

3. 执行命令make编译成执行文件

4. 测试是否编译成功

EMBOSS软件包下的needleall软件

进入安装目录下的emboss文件夹，将测试输入文件复制到一个目录(这步随意，找到文件即可)

执行命令./needleall -asequence ../test.fa -bsequence ../test.fa -auto -aformat3 pair -sprotein1 1 -sprotein2 1 -outfile out.aln



5. 收工