RStudio Linux Server 版本 安装配置 说明

之前写过一篇R 7个免费的GUI工具，参考Blog：

R 语言 7个 免费的GUI图像界面 工具 说明
http://blog.csdn.net/tianlesoftware/article/details/7305727
这篇看一下R>一.安装 RStudio Server

RStudio下载地址：
http://rstudio.org/download/
安装RStudio 工具之前需要先安装好R，关与Linux 下R的安装，参考：

 R 语言Linux 环境 安装 说明
http://blog.csdn.net/tianlesoftware/article/details/7317725
安装 RStudioServer 版本：

[root@rac1 R_Language]# rpm -Uvhrstudio-server-0.95.262-x86_64.rpm

Preparing...                ###########################################[100%]

  1:rstudio-server        ########################################### [100%]

rsession: no process killed

Starting rstudio-server: [  OK  ]

You have new mail in /var/spool/mail/root

二. 管理配置 RStudio Server

2.1 web 访问地址

安装并启动RStudioServer之后就可以通过web进行访问了，默认情况下RStudio Server 的端口是8787，所以，我们可以使用如下地址进行访问：
http://<server-ip>:8787
 

这里需要我们输入用户名和密码。关于用户名有2点注意事项：

（1）    不允许使用system 用户登陆，即用户ids小于100的用户.

示例：

[root@rac1 R_Language]# id

uid=0(root) gid=0(root)groups=0(root),1(bin),2(daemon),3(sys),4(adm),6(disk),10(wheel)context=unconfined_u:unconfined_r:unconfined_t:s0-s0:c0.c1023

--这里root 用户的UID 就是0

[root@rac1 R_Language]# su - oracle

rac1:/home/oracle> id

uid=500(oracle) gid=501(oinstall)groups=501(oinstall),502(dba),503(asmadmin),504(oper)context=unconfined_u:unconfined_r:unconfined_t:s0-s0:c0.c1023

--Oracle 用户的UID就是50.

（2）    用户的认证可以使用RSA。

如下是我用Oracle 用户登陆之后的截图：

如果我们不能通过web进行，可以使用如下命令验证rstudio server 的安装：

[root@rac1 R_Language]# rstudio-server verify-installation

Stopping rstudio-server:                                   [  OK  ]

Starting rstudio-server:                                   [  OK  ]

2.2 配置RStudio Server

       RStudio有2个配置文件，但是默认情况下，这2个文件没有创建，如果我们要修改这个配置，需要先创建这2个文件：

[root@rac1 rstudio]# touch /etc/rstudio/rserver.conf

[root@rac1 rstudio]# touch /etc/rstudio/rsession.conf

[root@rac1 rstudio]# ls

installed rserver.conf  rsession.conf  secure-cookie-key

创建配置文件之后就可以进行修改，修改完毕之后可以使用命令来验证修改的有效性：

[root@rac1 rstudio]# rstudio-server test-config

注意：

       这个命令在启动和关闭RStudio server 时也会自动执行。当配置无效时，这个验证也会报错。

2.2.1 配置网络端口和地址

默认的端口是8787，如果我们想改成其他端口，可以在/etc/rstudio/rserver.conf  文件中添加并修改参数：

www-port=80

--这里我们是将端口改成80.

       默认情况下，RStudio 是将IP地址绑定到0.0.0.0， 这样任何客户地址都可以访问。 我们可以改成其他地址，添加并修改参数：

       www-address=127.0.0.1

修改完毕之后要验证参数有效性，并重启rstudio-server。

[root@rac1 rstudio]# rstudio-server test-config

[root@rac1 rstudio]# rstudio-server restart

Stopping rstudio-server:                                   [  OK  ]

Starting rstudio-server:                                   [  OK  ]

2.2.2 设置扩展库

       如果我们添加其他的library到默认LD_LIBRARY_PATH 中指定库，可以通过rsession-ld-library-path参数，在/etc/rstudio/rserver.conf 文件中添加external library的位置即可，如：

rsession-ld-library-path=/opt/local/lib:/opt/local/someapp/lib

2.2.3 指定R 版本

       默认情况下，RStudio server 运行时使用的R是系统PATH中指定的R，这个位置可以使用which R确定，如果我们的系统上有多个版本的R，那么可以使用rsession-which-r参数指定RStudio 使用哪个版本的R。 如：

rsession-which-r=/usr/local/bin/R

在/etc/rstudio/rserver.conf文件里添加这个参数之后，必须重启rstudio server 才能生效。

2.2.4 设置用户限制

       如果有大量的用户使用，那么会消耗很多的资源，可以限制一些用户对资源的使用。

       在/etc/rstudio/rserver.conf文件中添加auth-required-user-group参数，可以指定访问rstudio 的用户：

auth-required-user-group=rstudio_users

验证一下：

[root@rac1 rstudio]# useradd dave

You have new mail in /var/spool/mail/root

[root@rac1 rstudio]# passwd dave

Changing password for user dave.

New password:

BAD PASSWORD: it is too short

BAD PASSWORD: is too simple

Retype new password:

passwd: all authentication tokens updatedsuccessfully.

[root@rac1 rstudio]# cat /etc/passwd|grepdave

dave:x:502:506::/home/dave:/bin/bash

--创建组，将dave 用户添加到该组：

[root@rac1 rstudio]# groupadd rstudio_users

[root@rac1 rstudio]# usermod -g rstudio_users -G rstudio_users dave

在/etc/rstudio/rserver.conf 文件中指定用户组，只有属于改组的用户才可以使用rstudio。

auth-required-user-group=rstudio_users

[root@rac1 rstudio]# rstudio-server test-config  

[root@rac1 rstudio]# rstudio-server restart

Stopping rstudio-server:                                   [  OK  ]

Starting rstudio-server:                                   [  OK  ]

现在就只有dave 用户能访问，oracle 用户就访问不了了。

当然也可以添加一些其他的资源限制，比如总内存，stack size 和进程数等，如：

rsession-memory-limit-mb=4000

rsession-stack-limit-mb=10

rsession-process-limit=100

添加到/etc/rstudio/rserver.conf后需要重启服务才能生效。

2.2.5 其他的设置

       前面讲的都是/etc/rstudio/rserver.conf配置，另一个配置文件是/etc/rstudio/rsession.conf ，其可以配置与R session 相关的信息。当R 用户很多时，这个参数就很有用，其可以显示session 信息。

       以下的配置都是写在/etc/rstudio/rsession.conf文件中。

       默认情况下，当用户2个小时没有执行命令，RStudio 会suspend 用户的R session，并将这些信息写入磁盘，从而减少资源的消耗，当用户下次使用时，session被还原。

       可以通过session-timeout-minutes 参数指定session 过期的时间，如：

session-timeout-minutes=30

       如果这里设置为0，则表示禁用该功能。用户session 将不会suspend，一直运行。

       其他的限制包括limit-file-upload-size-mb 参数，其可以显示最大的上传大小，如：

limit-file-upload-size-mb=100

       也可以指定默认的CRAN repository 服务地址，如：

r-cran-repos=http://cran.case.edu/

2.3 管理RStudio Server

       RStudio server 的管理通过rstudio-server 命令来进行，通过这个命令可以启用，停止，重启等操作。

[root@rac1 rstudio]# rstudio-server

Usage: rstudio-server{start|stop|restart|test-config|verify-installation|suspend-session|suspend-all|force-suspend-session|force-suspend-all|offline|online|active-sessions|version}

2.3.1 Stopping and Starting

如果使用包来安装的RStudio，那么会自动将RStudio 注册到系统了，在系统启动会自动启动。

在ubuntu系统上，启动脚本是：

/etc/init/rstudio-server.conf

在其他系统上，启动脚本在：

/etc/init.d/rstudio-server

手工的操作命令如下：

$ rstudio-server stop

$ rstudio-server start

$ rstudio-server restart

2.3.2 Managing Active Sessions

可以使用如下命令查看活动的session：

 [root@rac1 init.d]# rstudio-server active-sessions

 PID     TIME COMMAND

 496900:00:09 /usr/lib/rstudio-server/bin/rsession -u oracle

 838900:00:04 /usr/lib/rstudio-server/bin/rsession -u dave

You have new mail in /var/spool/mail/root

[root@rac1 init.d]#

这里有2个活动的session。

--suspend 某个session：

$ rstudio-server suspend-session<pid>

[root@rac1 init.d]# rstudio-serversuspend-session 4969

--suspend 所有session：

$ sudo rstudio-server suspend-all

[root@rac1 init.d]# sudo rstudio-serversuspend-all

Suspend 命令还有一个force 变量，其可以中断session的任何R操作：

$ sudo rstudio-server force-suspend-session<pid>

$ sudo rstudio-server force-suspend-all

在系统reboot 之前，会先执行force-suspend-all，从而保证活动 R sessions的数据及时写入disk。

2.3.3 Taking the Server Offline

       如果要进行系统维护，要让用户接收到一条友好的消息，可以执行serveroffline 操作，其会在用户web上显示server 临时offline。

[root@rac1 init.d]# rstudio-server offline

Stopping rstudio-server:                                   [  OK  ]

Starting rstudio-server:                                   [  OK  ]

You have new mail in /var/spool/mail/root

在用户的web会显示如下：

当维护结束，在让sever />

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