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hadoop2提交到Yarn: Mapreduce执行过程分析2

2015-11-03 20:46 477 查看
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问题导读:

1.hadoop哪些数据类型,是如何与Java数据类型对应的?

2.ApplicationMaster什么时候启动?

3.YarnChild进程什么时候产生?

4.如果在recuece的情况下,map任务完成暂总任务的多少百分比?

5.run的执行步骤是什么?

6.哪个方法来执行具体的map任务?

7.获取配置信息为哪个类?

8.TaskAttemptContextImpl还增加了什么信息?



4.3 Map类

创建Map类和map函数,map函数是org.apache.hadoop.mapreduce.Mapper类中的定义的,当处理每一个键值对的时候,都要调用一次map方法,用户需要覆写此方法。此外还有setup方法和cleanup方法。map方法是当map任务开始运行的时候调用一次,cleanup方法是整个map任务结束的时候运行一次。
4.3.1 Map介绍

Mapper类是一个泛型类,带有4个参数(输入的键,输入的值,输出的键,输出的值)。在这里输入的key为Object(默认是行),输入的值为Text(hadoop中的String类型),输出的key为Text(关键字)和输出的值为IntWritable(hadoop中的int类型)。以上所有hadoop数据类型和java的数据类型都很相像,除了它们是针对网络序列化而做的特殊优化。

MapReduce中的类似于IntWritable的类型还有如下几种:

BooleanWritable:标准布尔型数值、ByteWritable:单字节数值、DoubleWritable:双字节数值、FloatWritable:浮点数、IntWritable:整型数、LongWritable:长整型数、Text:使用UTF8格式存储的文本(类似java中的String)、NullWritable:当<key, value>中的key或value为空时使用。

这些都是实现了WritableComparable接口:



Map任务是一类将输入记录集转换为中间格式记录集的独立任务。 Mapper类中的map方法将输入键值对(key/value pair)映射到一组中间格式的键值对集合。这种转换的中间格式记录集不需要与输入记录集的类型一致。一个给定的输入键值对可以映射成0个或多个输出键值对。

StringTokenizer itr = new StringTokenizer(value.toString());

while (itr.hasMoreTokens()) {

word.set(itr.nextToken());

context.write(word, one);

}

复制代码

这里将输入的行进行解析分割之后,利用Context的write方法进行保存。而Context是实现了MapContext接口的一个抽象内部类。此处把解析出的每个单词作为key,将整形1作为对应的value,表示此单词出现了一次。map就是一个分的过程,reduce就是合的过程。Map任务的个数和前面的split的数目对应,作为map函数的输入。Map任务的具体执行见下一小节。
4.3.2 Map任务分析

Map任务被提交到Yarn后,被ApplicationMaster启动,任务的形式是YarnChild进程,在其中会执行MapTask的run方法。无论是MapTask还是ReduceTask都是继承的Task这个抽象类。

run方法的执行步骤有:

Step1:

判断是否有Reduce任务,如果没有的话,Map任务结束,就整个提交的作业结束;如果有的话,当Map任务完成的时候设置当前进度为66.7%,Sort完成的时候设置进度为33.3%。

Step2:

启动TaskReporter线程,用于更新当前的状态。

Step3:
初始化任务,设置任务的当前状态为RUNNING,设置输出目录等。

Step4:

判断当前是否是jobCleanup任务、jobSetup任务、taskCleanup任务及相应的处理。

Step5:

调用runNewMapper方法,执行具体的map。

Step6:

作业完成之后,调用done方法,进行任务的清理、计数器更新、任务状态更新等。
4.3.3 runNewMapper分析

下面我们来看看这个runNewMapper方法。代码如下:

private <INKEY,INVALUE,OUTKEY,OUTVALUE>

void runNewMapper(final JobConf job,

final TaskSplitIndex splitIndex,

final TaskUmbilicalProtocol umbilical,

TaskReporter reporter

) throws IOException, ClassNotFoundException,

InterruptedException {

// make a task context so we can get the classes

org.apache.hadoop.mapreduce.TaskAttemptContext taskContext = new org.apache.hadoop.mapreduce.task.TaskAttemptContextImpl(job, getTaskID(), reporter);

// make a mapper

org.apache.hadoop.mapreduce.Mapper<INKEY,INVALUE,OUTKEY,OUTVALUE> mapper = (org.apache.hadoop.mapreduce.Mapper<INKEY,INVALUE,OUTKEY,OUTVALUE>)

ReflectionUtils.newInstance(taskContext.getMapperClass(), job);

// make the input format org.apache.hadoop.mapreduce.InputFormat<INKEY,INVALUE> inputFormat = (org.apache.hadoop.mapreduce.InputFormat<INKEY,INVALUE>)

ReflectionUtils.newInstance(taskContext.getInputFormatClass(), job);

// rebuild the input split

org.apache.hadoop.mapreduce.InputSplit split = null;20

split = getSplitDetails(new path(splitIndex.getSplitLocation()), splitIndex.getStartOffset());

LOG.info("Processing split: " + split);

org.apache.hadoop.mapreduce.RecordReader<INKEY,INVALUE> input = new NewTrackingRecordReader<INKEY,INVALUE> (split, inputFormat, reporter, taskContext);

job.setBoolean(JobContext.SKIP_RECORDS, isSkipping());

org.apache.hadoop.mapreduce.RecordWriter output = null;

// get an output object

if (job.getNumReduceTasks() == 0) {

output = new NewDirectOutputCollector(taskContext, job, umbilical, reporter);

} else {

output = new NewOutputCollector(taskContext, job, umbilical, reporter);

}

org.apache.hadoop.mapreduce.MapContext<INKEY, INVALUE, OUTKEY, OUTVALUE> mapContext = new MapContextImpl<INKEY, INVALUE, OUTKEY, OUTVALUE>(job, getTaskID(), input, output, committer, reporter, split);

org.apache.hadoop.mapreduce.Mapper<INKEY,INVALUE,OUTKEY,OUTVALUE>.Context mapperContext = new WrappedMapper<INKEY, INVALUE, OUTKEY, OUTVALUE>().getMapContext(mapContext);

try {

input.initialize(split, mapperContext);

mapper.run(mapperContext);

mapPhase.complete();

setPhase(TaskStatus.Phase.SORT);

statusUpdate(umbilical);

input.close();

input = null;

output.close(mapperContext);

output = null;

} finally {

closeQuietly(input);

closeQuietly(output, mapperContext);

}

}

复制代码

此方法的主要执行流程是:

Step1:

获取配置信息类对象TaskAttemptContextImpl、自己开发的Mapper的实例mapper、用户指定的InputFormat对象 (默认是TextInputFormat)、任务对应的分片信息split。

其中TaskAttemptContextImpl类实现TaskAttemptContext接口,而TaskAttemptContext接口又继承于JobContext和Progressable接口,但是相对于JobContext增加了一些有关task的信息。通过TaskAttemptContextImpl对象可以获得很多与任务执行相关的类,比如用户定义的Mapper类,InputFormat类等。

Step2:

根据inputFormat构建一个NewTrackingRecordReader对象,这个对象中的RecordReader<K,V> real是LineRecordReader,用于读取分片中的内容,传递给Mapper的map方法做处理的。

Step3:

然后创建org.apache.hadoop.mapreduce.RecordWriter对象,作为任务的输出,如果没有reducer,就设置此RecordWriter对象为NewDirectOutputCollector(taskContext, job, umbilical, reporter)直接输出到HDFS上;如果有reducer,就设置此RecordWriter对象为NewOutputCollector(taskContext, job, umbilical, reporter)作为输出。

NewOutputCollector是有reducer的作业的map的输出。这个类的主要包含的对象是MapOutputCollector<K,V> collector,是利用反射工具构造出来的:

ReflectionUtils.newInstance(job.getClass(JobContext.MAP_OUTPUT_COLLECTOR_CLASS_ATTR, MapOutputBuffer.class, MapOutputCollector.class), job);

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如果Reduce的个数大于1,则实例化org.apache.hadoop.mapreduce.Partitioner<K,V> (默认是HashPartitioner.class),用来对mapper的输出数据进行分区,即数据要汇总到哪个reducer上,NewOutputCollector的write方法会调用collector.collect(key, value,partitioner.getPartition(key, value, partitions));否则设置分区个数为0。

Step4:

打开输入文件(构建一个LineReader对象,在这实现文件内容的具体读)并且将文件指针指向文件头。由LineRecordReader的initialize方法完成。

实际上读文件内容的是类中的LineReader对象in,该对象在initialize方法中进行了初始化,会根据输入文件的文件类型(压缩或不压缩)传入相应输入流对象。LineReader会从输入流对象中通过:

in.readLine(new Text(), 0, maxBytesToConsume(start));

方法每次读取一行放入Text对象str中,并返回读取数据的长度。

LineRecordReader.nextKeyValue()方法会设置两个对象key和value,key是一个偏移量指的是当前这行数据在输入文件中的偏移量(注意这个偏移量可不是对应单个分片内的偏移量,而是针对整个文中的偏移量),value是通过LineReader的对象in读取的一行内容:

in.readLine(value, maxLineLength, Math.max(maxBytesToConsume(pos), maxLineLength));

复制代码

如果没有数据可读了,这个方法会返回false,否则true。

另外,getCurrentKey()和getCurrentValue()是获取当前的key和value,调用这俩方法之前需要先调用nextKeyValue()为key和value赋新值,否则会重复。

这样就跟org.apache.hadoop.mapreduce.Mapper中的run方法关联起来了。

Step5:

执行org.apache.hadoop.mapreduce.Mapper的run方法。

public void run(Context context) throws IOException, InterruptedException {

setup(context);

try {

while (context.nextKeyValue()) {

map(context.getCurrentKey(), context.getCurrentValue(), context);

}

} finally {

cleanup(context);

}

}

复制代码

Step5.1:

首先会执行setup方法,用于设定用户自定义的一些参数等,方便在下面的操作步骤中读取。参数是设置在Context中的。此对象的初始化在MapTask类中的runNewMapper方法中:

org.apache.hadoop.mapreduce.Mapper<INKEY,INVALUE,OUTKEY,OUTVALUE>.Context

mapperContext = new WrappedMapper<INKEY, INVALUE, OUTKEY, OUTVALUE>().getMapContext(mapContext);

复制代码

会将LineRecordReader的实例对象和NewOutputCollector的实例对象传进去,下面的nextKeyValue()、getCurrentValue()、getCurrentKey()会调用reader的相应方法,从而实现了Mapper.run方法中的nextKeyValue()不断获取key和value。

Step5.2:

循环中的map方法就是用户自定的map。map方法逻辑处理完之后,最后都会有context.write(K,V)方法用来将计算数据输出。此write方法最后调用的是NewOutputCollector.write方法,write方法会调用MapOutputBuffer.collect(key, value,partitioner.getPartition(key, value, partitions))方法,用于汇报进度、序列化数据并将其缓存等,主要是里面还有个Spill的过程,下一小节会详细介绍。

Step5.3:

当读完数据之后,会调用cleanup方法来做一些清理工作,这点我们同样可以利用,我们可以根据自己的需要重写cleanup方法。

Step6:

最后是输出流的关闭output.close(mapperContext),该方法会执行MapOutputBuffer.flush()操作会将剩余的数据也通过sortAndSpill()方法写入本地文件,并在最后调用mergeParts()方法合并所有spill文件。sortAndSpill方法在4.3.4小节中会介绍。
4.3.4 Spill分析

Spill的汉语意思是溢出,spill处理就是溢出写。怎么个溢出法呢?Spill过程包括输出、排序、溢写、合并等步骤,有点复杂,如图所示:



每个Map任务不断地以<key, value>对的形式把数据输出到在内存中构造的一个环形数据结构中。使用环形数据结构是为了更有效地使用内存空间,在内存中放置尽可能多的数据。

这个数据结构其实就是个字节数组,叫kvbuffer,这里面不只有<key, value>数据,还放置了一些索引数据,并且给放置索引数据的区域起了一个kvmeta的别名。

kvbuffer = new byte[maxMemUsage];

bufvoid = kvbuffer.length;

kvmeta = ByteBuffer.wrap(kvbuffer).order(ByteOrder.nativeOrder()).asIntBuffer();

setEquator(0);

bufstart = bufend = bufindex = equator;

kvstart = kvend = kvindex;

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kvmeta是对记录Record<key, value>在kvbuffer中的索引,是个四元组,包括:value的起始位置、key的起始位置、partition值、value的长度,占用四个Int长度,kvmeta的存放指针kvindex每次都是向下跳四步,然后再向上一个坑一个坑地填充四元组的数据。比如kvindex初始位置是-4,当第一个<key, value>写完之后,(kvindex+0)的位置存放value的起始位置、(kvindex+1)的位置存放key的起始位置、(kindex+2)的位置存放partition的值、(kvindex+3)的位置存放value的长度,然后kvindex跳到-8位置,等第二个<key,
value>和索引写完之后,kvindex跳到-32位置。

<key, value>数据区域和索引数据区域在kvbuffer中是相邻不重叠的两个区域,用一个分界点来划分两者,而分割点是变化的,每次Spill之后都会更新一次。初始的分界点是0,<key, value>数据的存储方向是向上增长,索引数据的存储方向是向下增长,如图所示:



其中,kvbuffer的大小maxMemUsage的默认是100M。涉及到的变量有点多:

(1)kvstart是有效记录开始的下标;

(2)kvindex是下一个可做记录的位置;

(3)kvend在开始Spill的时候它会被赋值为kvindex的值,Spill结束时,它的值会被赋给kvstart,这时候kvstart==kvend。这就是说,如果kvstart不等于kvend,系统正在spill,否则,kvstart==kvend,系统处于普通工作状态;

(4)bufvoid,用于表明实际使用的缓冲区结尾;

(5)bufmark,用于标记记录的结尾;

(6)bufindex初始值为0,一个Int型的key写完之后,bufindex增长为4,一个Int型的value写完之后,bufindex增长为8

在kvindex和bufindex之间(包括equator节点)的那一坨数据就是未被Spill的数据。如果这部分数据所占用的空间大于等于Spill的指定百分比(默认是80%),则开始调用startSpill方法进行溢写。对应的方法为:

private void startSpill() {

assert !spillInProgress;

kvend = (kvindex + NMETA) % kvmeta.capacity();

bufend = bufmark;

spillInProgress = true;

LOG.info("Spilling map output");

LOG.info("bufstart = " + bufstart + "; bufend = " + bufmark +

"; bufvoid = " + bufvoid);

LOG.info("kvstart = " + kvstart + "(" + (kvstart * 4) +

"); kvend = " + kvend + "(" + (kvend * 4) +

"); length = " + (distanceTo(kvend, kvstart,

kvmeta.capacity()) + 1) + "/" + maxRec);

spillReady.signal();

}

复制代码

这里会触发信号量,使得在MapTask类的init方法中正在等待的SpillThread线程继续运行。

while (true) {

spillDone.signal();

while (!spillInProgress) {

spillReady.await();

}

try {

spillLock.unlock();

sortAndSpill();

} catch (Throwable t) {

sortSpillException = t;

} finally {

spillLock.lock();

if (bufend < bufstart) {

bufvoid = kvbuffer.length;

}

kvstart = kvend;

bufstart = bufend;

spillInProgress = false;

}

}

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继续调用sortAndSpill方法,此方法负责将buf中的数据刷到磁盘。主要是根据排过序的kvmeta把每个partition的<key, value>数据写到文件中,一个partition对应的数据搞完之后顺序地搞下个partition,直到把所有的partition遍历完(partiton的个数就是reduce的个数)。

Step1:

先计算写入文件的大小;

final long size = (bufend >= bufstart? bufend - bufstart: (bufvoid - bufend) + bufstart) +partitions * APPROX_HEADER_LENGTH;

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Step2:

然后获取写到本地(非HDFS)文件的文件名,会有一个编号,例如output/spill2.out;命名格式对应的代码为:

return lDirAlloc.getLocalPathForWrite(MRJobConfig.OUTPUT + "/spill"

+ spillNumber + ".out", size, getConf());

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Step3:

使用快排对缓冲区kvbuffe中区间[bufstart,bufend)内的数据进行排序,先按分区编号partition进行升序,然后按照key进行升序。这样经过排序后,数据以分区为单位聚集在一起,且同一分区内所有数据按照key有序;

Step4:

构建一个IFile.Writer对象将输出流传进去,输出到指定的文件当中,这个对象支持行级的压缩。

writer = new Writer<K, V>(job, out, keyClass, valClass, codec, spilledRecordsCounter);

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如果用户设置了Combiner(实际上是一个Reducer),则写入文件之前会对每个分区中的数据进行一次聚集操作,通过combinerRunner.combine(kvIter, combineCollector)实现,进而会执行reducer.run方法,只不过输出和正常的reducer不一样而已,这里最终会调用IFile.Writer的append方法实现本地文件的写入。

Step5:

将元数据信息写到内存索引数据结构SpillRecord中。如果内存中索引大于1MB,则写到文件名类似于output/spill2.out.index的文件中,“2”就是当前Spill的次数。

if (totalIndexCacheMemory >= indexCacheMemoryLimit) {

// create spill index file

Path indexFilename =

mapOutputFile.getSpillIndexFileForWrite(numSpills, partitions

* MAP_OUTPUT_INDEX_RECORD_LENGTH);

spillRec.writeToFile(indexFilename, job);

} else {

indexCacheList.add(spillRec);

totalIndexCacheMemory +=

spillRec.size() * MAP_OUTPUT_INDEX_RECORD_LENGTH;

}

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index文件中不光存储了索引数据,还存储了crc32的校验数据。index文件不一定在磁盘上创建,如果内存(默认1M空间)中能放得下就放在内存中。

out文件、index文件和partition数据文件的对应关系为:



索引文件的信息主要包括partition的元数据的偏移量、大小、压缩后的大小等。

Step6:

Spill结束的时候,会调用resetSpill方法进行重置。

private void resetSpill() {

final int e = equator;

bufstart = bufend = e;

final int aligned = e - (e % METASIZE);

// set start/end to point to first meta record

// Cast one of the operands to long to avoid integer overflow

kvstart = kvend = (int)

(((long)aligned - METASIZE + kvbuffer.length) % kvbuffer.length) / 4;

LOG.info("(RESET) equator " + e + " kv " + kvstart + "(" +

(kvstart * 4) + ")" + " kvi " + kvindex + "(" + (kvindex * 4) + ")");

}

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也就是取kvbuffer中剩余空间的中间位置,用这个位置设置为新的分界点。
4.3.5 合并

Map任务如果输出数据量很大,可能会进行好几次Spill,out文件和Index文件会产生很多,分布在不同的磁盘上。这时候就需要merge操作把这些文件进行合并。

Merge会从所有的本地目录上扫描得到Index文件,然后把索引信息存储在一个列表里,最后根据列表来创建一个叫file.out的文件和一个叫file.out.Index的文件用来存储最终的输出和索引。

每个artition都应一个段列表,记录所有的Spill文件中对应的这个partition那段数据的文件名、起始位置、长度等等。所以首先会对artition对应的所有的segment进行合并,合并成一个segment。当这个partition对应很多个segment时,会分批地进行合并,类似于堆排序。最终的索引数据仍然输出到Index文件中。对应mergeParts方法。
4.3.6 相关配置选项

Map的东西大概的就这么多。主要是读取数据然后写入内存缓冲区,缓存区满足条件就会快排,并设置partition,然后Spill到本地文件和索引文件;如果有combiner,Spill之前也会做一次聚集操作,等数据跑完会通过归并合并所有spill文件和索引文件,如果有combiner,合并之前在满足条件后会做一次综合的聚集操作。map阶段的结果都会存储在本地中(如果有reducer的话),非HDFS。

在上面的分析,包括过程的梳理中,主要涉及到以下几种配置选项:

mapreduce.job.map.output.collector.class,默认为MapTask.MapOutputBuffer;

mapreduce.map.sort.spill.percent配置内存开始溢写的百分比值,默认为0.8;

mapreduce.task.io.sort.mb配置内存bufer的大小,默认是100mb;

map.sort.class配置排序实现类,默认为QuickSort,快速排序;

mapreduce.map.output.compress.codec配置map的输出的压缩处理程序;

mapreduce.map.output.compress配置map输出是否启用压缩,默认为false
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