perl调用linux程序时简写问题

今天写的一个perl脚本需要调用samtools view，在系统bashrc中，使用简写view表示samtools view，

然后再perl中使用简写，脚本如下：

#!/usr/bin/perl
use strict;
use 5.010;
my $datadir = shift;
my @bamfiles = glob "$datadir/*.bam";
for my $bamfile (@bamfiles) {
my $total = `view -c $bamfile`;
say $total;
}
运行时，提示：

Vim: Warning: Output is not to a terminal

（光标）

然后卡住不动，纳闷，将view改回全写samtools view

结果输出：

28400342
（空行）
25923609
（空行）
25497987
（空行）

这是为什么呢？