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[Hadoop源码解读](一)MapReduce篇之InputFormat

2014-08-10 22:47 537 查看
平时我们写MapReduce程序的时候,在设置输入格式的时候,总会调用形如job.setInputFormatClass(KeyValueTextInputFormat.class);来保证输入文件按照我们想要的格式被读取。所有的输入格式都继承于InputFormat,这是一个抽象类,其子类有专门用于读取普通文件的FileInputFormat,用来读取数据库的DBInputFormat等等。

其实,一个输入格式InputFormat,主要无非就是要解决如何将数据分割成分片[比如多少行为一个分片],以及如何读取分片中的数据[比如按行读取]。前者由getSplits()完成,后者由RecordReader完成。



不同的InputFormat都会按自己的实现来读取输入数据并产生输入分片,一个输入分片会被单独的map task作为数据源。下面我们先看看这些输入分片(inputSplit)是什么样的。

InputSplit:

我们知道Mappers的输入是一个一个的输入分片,称InputSplit。InputSplit是一个抽象类,它在逻辑上包含了提供给处理这个InputSplit的Mapper的所有K-V对。

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public abstract class InputSplit {

public abstract long getLength() throws IOException, InterruptedException;

public abstract

String[] getLocations() throws IOException, InterruptedException;

}

getLength()用来获取InputSplit的大小,以支持对InputSplits进行排序,而getLocations()则用来获取存储分片的位置列表。

我们来看一个简单InputSplit子类:FileSplit。

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public class FileSplit extends InputSplit implements Writable {

private Path file;

private long start;

private long length;

private String[] hosts;

FileSplit() {}

public FileSplit(Path file, long start, long length, String[] hosts) {

this.file = file;

this.start = start;

this.length = length;

this.hosts = hosts;

}

//序列化、反序列化方法,获得hosts等等……

}

从上面的源码我们可以看到,一个FileSplit是由文件路径,分片开始位置,分片大小和存储分片数据的hosts列表组成,由这些信息我们就可以从输入文件中切分出提供给单个Mapper的输入数据。这些属性会在Constructor设置,我们在后面会看到这会在InputFormat的getSplits()中构造这些分片。

我们再看CombineFileSplit:

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public class CombineFileSplit extends InputSplit implements Writable {

private Path[] paths;

private long[] startoffset;

private long[] lengths;

private String[] locations;

private long totLength;

public CombineFileSplit() {}

public CombineFileSplit(Path[] files, long[] start,

long[] lengths, String[] locations) {

initSplit(files, start, lengths, locations);

}

public CombineFileSplit(Path[] files, long[] lengths) {

long[] startoffset = new long[files.length];

for (int i = 0; i < startoffset.length; i++) {

startoffset[i] = 0;

}

String[] locations = new String[files.length];

for (int i = 0; i < locations.length; i++) {

locations[i] = "";

}

initSplit(files, startoffset, lengths, locations);

}

private void initSplit(Path[] files, long[] start,

long[] lengths, String[] locations) {

this.startoffset = start;

this.lengths = lengths;

this.paths = files;

this.totLength = 0;

this.locations = locations;

for(long length : lengths) {

totLength += length;

}

}

//一些getter和setter方法,和序列化方法

}

与FileSplit类似,CombineFileSplit同样包含文件路径,分片起始位置,分片大小和存储分片数据的host列表,由于CombineFileSplit是针对小文件的,它把很多小文件包在一个InputSplit内,这样一个Mapper就可以处理很多小文件。要知道我们上面的FileSplit是对应一个输入文件的,也就是说如果用FileSplit对应的FileInputFormat来作为输入格式,那么即使文件特别小,也是单独计算成一个输入分片来处理的。当我们的输入是由大量小文件组成的,就会导致有同样大量的InputSplit,从而需要同样大量的Mapper来处理,这将很慢,想想有一堆map
task要运行!!这是不符合Hadoop的设计理念的,Hadoop是为处理大文件优化的。

最后介绍TagInputSplit,这个类就是封装了一个InputSplit,然后加了一些tags在里面满足我们需要这些tags数据的情况,我们从下面就可以一目了然。

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class TaggedInputSplit extends InputSplit implements Configurable, Writable {

private Class<? extends InputSplit> inputSplitClass;

private InputSplit inputSplit;

@SuppressWarnings("unchecked")

private Class<? extends InputFormat> inputFormatClass;

@SuppressWarnings("unchecked")

private Class<? extends Mapper> mapperClass;

private Configuration conf;

//getters and setters,序列化方法,getLocations()、getLength()等

}

现在我们对InputSplit的概念有了一些了解,我们继续看它是怎么被使用和计算出来的。

InputFormat:

通过使用InputFormat,MapReduce框架可以做到:

1、验证作业的输入的正确性

2、将输入文件切分成逻辑的InputSplits,一个InputSplit将被分配给一个单独的Mapper task

3、提供RecordReader的实现,这个RecordReader会从InputSplit中正确读出一条一条的K-V对供Mapper使用。

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public abstract class InputFormat<K, V> {

public abstract

List<InputSplit> getSplits(JobContext context

) throws IOException, InterruptedException;

public abstract

RecordReader<K,V> createRecordReader(InputSplit split,

TaskAttemptContext context

) throws IOException,

InterruptedException;

}

上面是InputFormat的源码,getSplits用来获取由输入文件计算出来的InputSplits,我们在后面会看到计算InputSplits的时候会考虑到输入文件是否可分割、文件存储时分块的大小和文件大小等因素;而createRecordReader()提供了前面第三点所说的RecordReader的实现,以将K-V对从InputSplit中正确读出来,比如LineRecordReader就以偏移值为key,一行的数据为value,这就使得所有其createRecordReader()返回了LineRecordReader的InputFormat都是以偏移值为key,一行数据为value的形式读取输入分片的。

FileInputFormat:

PathFilter被用来进行文件筛选,这样我们就可以控制哪些文件要作为输入,哪些不作为输入。PathFilter有一个accept(Path)方法,当接收的Path要被包含进来,就返回true,否则返回false。可以通过设置mapred.input.pathFilter.class来设置用户自定义的PathFilter。

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public interface PathFilter {

boolean accept(Path path);

}

FileInputFormat是InputFormat的子类,它包含了一个MultiPathFilter,这个MultiPathFilter由一个过滤隐藏文件(名字前缀为'-'或'.')的PathFilter和一些可能存在的用户自定义的PathFilters组成,MultiPathFilter会在listStatus()方法中使用,而listStatus()方法又被getSplits()方法用来获取输入文件,也就是说实现了在获取输入分片前先进行文件过滤。

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private static class MultiPathFilter implements PathFilter {

private List<PathFilter> filters;

public MultiPathFilter(List<PathFilter> filters) {

this.filters = filters;

}

public boolean accept(Path path) {

for (PathFilter filter : filters) {

if (!filter.accept(path)) {

return false;

}

}

return true;

}

}

这些PathFilter会在listStatus()方法中用到,listStatus()是用来获取输入数据列表的。

下面是FileInputFormat的getSplits()方法,它首先得到分片的最小值minSize和最大值maxSize,它们会被用来计算分片大小。可以通过设置mapred.min.split.size和mapred.max.split.size来设置。splits链表用来存储计算得到的输入分片,files则存储作为由listStatus()获取的输入文件列表。然后对于每个输入文件,判断是否可以分割,通过computeSplitSize计算出分片大小splitSize,计算方法是:Math.max(minSize,
Math.min(maxSize, blockSize));也就是保证在minSize和maxSize之间,且如果minSize<=blockSize<=maxSize,则设为blockSize。然后我们根据这个splitSize计算出每个文件的inputSplits集合,然后加入分片列表splits中。注意到我们生成InputSplit的时候按上面说的使用文件路径,分片起始位置,分片大小和存放这个文件的hosts列表来创建。最后我们还设置了输入文件数量:mapreduce.input.num.files。

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public List<InputSplit> getSplits(JobContext job

) throws IOException {

long minSize = Math.max(getFormatMinSplitSize(), getMinSplitSize(job));

long maxSize = getMaxSplitSize(job);

// generate splits

List<InputSplit> splits = new ArrayList<InputSplit>();

List<FileStatus>files = listStatus(job);

for (FileStatus file: files) {

Path path = file.getPath();

FileSystem fs = path.getFileSystem(job.getConfiguration());

long length = file.getLen();

BlockLocation[] blkLocations = fs.getFileBlockLocations(file, 0, length);

if ((length != 0) && isSplitable(job, path)) {

long blockSize = file.getBlockSize();

long splitSize = computeSplitSize(blockSize, minSize, maxSize);

long bytesRemaining = length;

while (((double) bytesRemaining)/splitSize > SPLIT_SLOP) {

int blkIndex = getBlockIndex(blkLocations, length-bytesRemaining);

splits.add(new FileSplit(path, length-bytesRemaining, splitSize,

blkLocations[blkIndex].getHosts()));

bytesRemaining -= splitSize;

}

if (bytesRemaining != 0) {

splits.add(new FileSplit(path, length-bytesRemaining, bytesRemaining,

blkLocations[blkLocations.length-1].getHosts()));

}

} else if (length != 0) {

splits.add(new FileSplit(path, 0, length, blkLocations[0].getHosts()));

} else {

//Create empty hosts array for zero length files

splits.add(new FileSplit(path, 0, length, new String[0]));

}

}

// Save the number of input files in the job-conf

job.getConfiguration().setLong(NUM_INPUT_FILES, files.size());

LOG.debug("Total # of splits: " + splits.size());

return splits;

}

//……setters and getters

就这样,利用FileInputFormat 的getSplits方法,我们就计算出了我们的作业的所有输入分片了。

那这些计算出来的分片是怎么被map读取出来的呢?就是InputFormat中的另一个方法createRecordReader(),FileInputFormat并没有对这个方法做具体的要求,而是交给子类自行去实现它。

RecordReader:

RecordReader是用来从一个输入分片中读取一个一个的K -V 对的抽象类,我们可以将其看作是在InputSplit上的迭代器。我们从类图中可以看到它的一些方法,最主要的方法就是nextKeyvalue()方法,由它获取分片上的下一个K-V 对。

我们再深入看看上面提到的RecordReader的一个子类:LineRecordReader。

LineRecordReader由一个FileSplit构造出来,start是这个FileSplit的起始位置,pos是当前读取分片的位置,end是分片结束位置,in是打开的一个读取这个分片的输入流,它是使用这个FileSplit对应的文件名来打开的。key和value则分别是每次读取的K-V对。然后我们还看到可以利用getProgress()来跟踪读取分片的进度,这个函数就是根据已经读取的K-V对占总K-V对的比例来显示进度的。

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public class LineRecordReader extends RecordReader<LongWritable, Text> {

private static final Log LOG = LogFactory.getLog(LineRecordReader.class);

private CompressionCodecFactory compressionCodecs = null;

private long start;

private long pos;

private long end;

private LineReader in;

private int maxLineLength;

private LongWritable key = null;

private Text value = null;

//我们知道LineRecordReader是读取一个InputSplit的,它从InputSplit中不断以其定义的格式读取K-V对

//initialize函数主要是计算分片的始末位置,以及打开想要的输入流以供读取K-V对,输入流另外处理分片经过压缩的情况

public void initialize(InputSplit genericSplit,

TaskAttemptContext context) throws IOException {

FileSplit split = (FileSplit) genericSplit;

Configuration job = context.getConfiguration();

this.maxLineLength = job.getInt("mapred.linerecordreader.maxlength",

Integer.MAX_VALUE);

start = split.getStart();

end = start + split.getLength();

final Path file = split.getPath();

compressionCodecs = new CompressionCodecFactory(job);

final CompressionCodec codec = compressionCodecs.getCodec(file);

// open the file and seek to the start of the split

FileSystem fs = file.getFileSystem(job);

FSDataInputStream fileIn = fs.open(split.getPath());

boolean skipFirstLine = false;

if (codec != null) {

in = new LineReader(codec.createInputStream(fileIn), job);

end = Long.MAX_VALUE;

} else {

if (start != 0) {

skipFirstLine = true;

--start;

fileIn.seek(start);

}

in = new LineReader(fileIn, job);

}

if (skipFirstLine) { // skip first line and re-establish "start".

start += in.readLine(new Text(), 0,

(int)Math.min((long)Integer.MAX_VALUE, end - start));

}

this.pos = start;

}

public boolean nextKeyValue() throws IOException {

if (key == null) {

key = new LongWritable();

}

key.set(pos); //对于LineRecordReader来说,它以偏移值为key,以一行为value

if (value == null) {

value = new Text();

}

int newSize = 0;

while (pos < end) {

newSize = in.readLine(value, maxLineLength,

Math.max((int)Math.min(Integer.MAX_VALUE, end-pos),

maxLineLength));

if (newSize == 0) {

break;

}

pos += newSize;

if (newSize < maxLineLength) {

break;

}

// line too long. try again

LOG.info("Skipped line of size " + newSize + " at pos " +

(pos - newSize));

}

if (newSize == 0) {

key = null;

value = null;

return false;

} else {

return true;

}

}

@Override

public LongWritable getCurrentKey() {

return key;

}

@Override

public Text getCurrentValue() {

return value;

}

/**

* Get the progress within the split

*/

public float getProgress() {

if (start == end) {

return 0.0f;

} else {

return Math.min(1.0f, (pos - start) / (float)(end - start));//读取进度由已读取InputSplit大小比总InputSplit大小

}

}

public synchronized void close() throws IOException {

if (in != null) {

in.close();

}

}

}

其它的一些RecordReader如SequenceFileRecordReader,CombineFileRecordReader.java等则对应不同的InputFormat。

下面继续看看这些RecordReader是如何被MapReduce框架使用的。

我们先看看Mapper.class是什么样的:

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public class Mapper<KEYIN, VALUEIN, KEYOUT, VALUEOUT> {

public class Context

extends MapContext<KEYIN,VALUEIN,KEYOUT,VALUEOUT> {

public Context(Configuration conf, TaskAttemptID taskid,

RecordReader<KEYIN,VALUEIN> reader,

RecordWriter<KEYOUT,VALUEOUT> writer,

OutputCommitter committer,

StatusReporter reporter,

InputSplit split) throws IOException, InterruptedException {

super(conf, taskid, reader, writer, committer, reporter, split);

}

}

/**

* Called once at the beginning of the task.

*/

protected void setup(Context context

) throws IOException, InterruptedException {

// NOTHING

}

/**

* Called once for each key/value pair in the input split. Most applications

* should override this, but the default is the identity function.

*/

@SuppressWarnings("unchecked")

protected void map(KEYIN key, VALUEIN value,

Context context) throws IOException, InterruptedException {

context.write((KEYOUT) key, (VALUEOUT) value);

}

/**

* Called once at the end of the task.

*/

protected void cleanup(Context context

) throws IOException, InterruptedException {

// NOTHING

}

/**

* Expert users can override this method for more complete control over the

* execution of the Mapper.

* @param context

* @throws IOException

*/

public void run(Context context) throws IOException, InterruptedException {

setup(context);

while (context.nextKeyValue()) {

map(context.getCurrentKey(), context.getCurrentValue(), context);

}

cleanup(context);

}

我们写MapReduce程序的时候,我们写的mapper都要继承这个Mapper.class,通常我们会重写map()方法,map()每次接受一个K-V对,然后我们对这个K-V对进行处理,再分发出处理后的数据。我们也可能重写setup()以对这个map task进行一些预处理,比如创建一个List之类的;我们也可能重写cleanup()方法对做一些处理后的工作,当然我们也可能在cleanup()中写出K-V对。举个例子就是:InputSplit的数据是一些整数,然后我们要在mapper中算出它们的和。我们就可以在先设置个sum属性,然后map()函数处理一个K-V对就是将其加到sum上,最后在cleanup()函数中调用context.write(key,value);

最后我们看看Mapper.class中的run()方法,它相当于map task的驱动,我们可以看到run()方法首先调用setup()进行初始操作,然后对每个context.nextKeyValue()获取的K-V对,就调用map()函数进行处理,最后调用cleanup()做最后的处理。事实上,从text他.nextKeyValue()就是使用了相应的RecordReader来获取K-V对的。

我们看看Mapper.class中的Context类,它继承与MapContext,使用了一个RecordReader进行构造。下面我们再看这个MapContext。

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public class MapContext<KEYIN,VALUEIN,KEYOUT,VALUEOUT>

extends TaskInputOutputContext<KEYIN,VALUEIN,KEYOUT,VALUEOUT> {

private RecordReader<KEYIN,VALUEIN> reader;

private InputSplit split;

public MapContext(Configuration conf, TaskAttemptID taskid,

RecordReader<KEYIN,VALUEIN> reader,

RecordWriter<KEYOUT,VALUEOUT> writer,

OutputCommitter committer,

StatusReporter reporter,

InputSplit split) {

super(conf, taskid, writer, committer, reporter);

this.reader = reader;

this.split = split;

}

/**

* Get the input split for this map.

*/

public InputSplit getInputSplit() {

return split;

}

@Override

public KEYIN getCurrentKey() throws IOException, InterruptedException {

return reader.getCurrentKey();

}

@Override

public VALUEIN getCurrentValue() throws IOException, InterruptedException {

return reader.getCurrentValue();

}

@Override

public boolean nextKeyValue() throws IOException, InterruptedException {

return reader.nextKeyValue();

}

}

我们可以看到MapContext直接是使用传入的RecordReader来进行K-V对的读取了。

到现在,我们已经知道输入文件是如何被读取、过滤、分片、读出K-V对,然后交给我们的Mapper类来处理的了。

最后,我们来看看FileInputFormat的几个子类。


TextInputFormat:

TextInputFormat是FileInputFormat的子类,其createRecordReader()方法返回的就是LineRecordReader。

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public class TextInputFormat extends FileInputFormat<LongWritable, Text> {

@Override

public RecordReader<LongWritable, Text>

createRecordReader(InputSplit split,

TaskAttemptContext context) {

return new LineRecordReader();

}

@Override

protected boolean isSplitable(JobContext context, Path file) {

CompressionCodec codec =

new CompressionCodecFactory(context.getConfiguration()).getCodec(file);

return codec == null;

}

}

我们还看到isSplitable()方法,当文件使用压缩的形式,这个文件就不可分割,否则就读取不到正确的数据了。这从某种程度上将影响分片的计算。有时我们希望一个文件只被一个Mapper处理的时候,我们就可以重写isSplitable()方法,告诉MapReduce框架,我哪些文件可以分割,哪些文件不能分割而只能作为一个分片。


NLineInputFormat;

NLineInputFormat也是FileInputFormat的子类,与名字一致,它是根据行数来划分InputSplits而不是像TextInputFormat那样依赖分片大小和行的长度的。也就是说,TextInputFormat当一行很长或分片比较小时,获取的分片可能只包含很少的K-V对,这样一个map task处理的K-V对就很少,这可能很不理想。因此我们可以使用NLineInputFormat来控制一个map
task处理的K-V对,这是通过分割InputSplits时按行数分割的方法来实现的,这我们在代码中可以看出来。我们可以设置mapreduce.input.lineinputformat.linespermap来设置这个行数。

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public class NLineInputFormat extends FileInputFormat<LongWritable, Text> {

public static final String LINES_PER_MAP =

"mapreduce.input.lineinputformat.linespermap";

public RecordReader<LongWritable, Text> createRecordReader(

InputSplit genericSplit, TaskAttemptContext context)

throws IOException {

context.setStatus(genericSplit.toString());

return new LineRecordReader();

}

/**

* Logically splits the set of input files for the job, splits N lines

* of the input as one split.

*

* @see FileInputFormat#getSplits(JobContext)

*/

public List<InputSplit> getSplits(JobContext job)

throws IOException {

List<InputSplit> splits = new ArrayList<InputSplit>();

int numLinesPerSplit = getNumLinesPerSplit(job);

for (FileStatus status : listStatus(job)) {

splits.addAll(getSplitsForFile(status,

job.getConfiguration(), numLinesPerSplit));

}

return splits;

}

public static List<FileSplit> getSplitsForFile(FileStatus status,

Configuration conf, int numLinesPerSplit) throws IOException {

List<FileSplit> splits = new ArrayList<FileSplit> ();

Path fileName = status.getPath();

if (status.isDir()) {

throw new IOException("Not a file: " + fileName);

}

FileSystem fs = fileName.getFileSystem(conf);

LineReader lr = null;

try {

FSDataInputStream in = fs.open(fileName);

lr = new LineReader(in, conf);

Text line = new Text();

int numLines = 0;

long begin = 0;

long length = 0;

int num = -1;

while ((num = lr.readLine(line)) > 0) {

numLines++;

length += num;

if (numLines == numLinesPerSplit) {

// NLineInputFormat uses LineRecordReader, which always reads

// (and consumes) at least one character out of its upper split

// boundary. So to make sure that each mapper gets N lines, we

// move back the upper split limits of each split

// by one character here.

if (begin == 0) {

splits.add(new FileSplit(fileName, begin, length - 1,

new String[] {}));

} else {

splits.add(new FileSplit(fileName, begin - 1, length,

new String[] {}));

}

begin += length;

length = 0;

numLines = 0;

}

}

if (numLines != 0) {

splits.add(new FileSplit(fileName, begin, length, new String[]{}));

}

} finally {

if (lr != null) {

lr.close();

}

}

return splits;

}

/**

* Set the number of lines per split

* @param job the job to modify

* @param numLines the number of lines per split

*/

public static void setNumLinesPerSplit(Job job, int numLines) {

job.getConfiguration().setInt(LINES_PER_MAP, numLines);

}

/**

* Get the number of lines per split

* @param job the job

* @return the number of lines per split

*/

public static int getNumLinesPerSplit(JobContext job) {

return job.getConfiguration().getInt(LINES_PER_MAP, 1);

}

现在,我们对Hadoop的输入格式和其在MapReduce中如何被使用有了具体的了解了。

来源:http://blog.csdn.net/posa88/article/details/7897963
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