使用源码编译3D Slicer3的一些注意事项

    3D Slicer是一款开源的用于医学图像分析（主要是分割和配准）与可视化成像的软件，可以将自己的插件加入到3D Slicer软件中来实现我们想要的功能，是一个检测算法与改进算法的平台。

    最近花了一些时间进行了3D Slicer3的编译工作，最新版本是Slicer4，但最近版本对很多模块进行了重构，所以因为一些原因选择了旧的版本（其实编译过程是相似的）。

    整体的编译过程网上有几位博主做了总结，我只说下我的实际过程中遇到的问题。

    在编译过程中，最为艰难的是通过CMake的配置生成工程文件，我是使用了VS2008的编译环境，实践发现最好还是放弃VS2010吧，兼容性太差，会出现莫名其妙的错误。

    网上几篇相关博客都做了相互之间直接的参考，详细过程不再赘述，我这里只介绍一些他们同时忽略的问题。

    1、编译过程是在CMake中先配置好其他引用的函数库，再生出工程，但网上大部分理解为在实际编译过程中在线下载，我实践的结果是，这样做不可谓不行，但实在是太慢了。官网中其实给出了需要引用的开源库目录，在http://viewvc.slicer.org/viewvc.cgi/Slicer3/中列出，但没有提供下载，这里我找到了另一个SVN的可下载地址：http://www.na-mic.org/svn/Slicer3/trunk/Libs/。

    其中包含了除Qt以及VTK之外的各种相关文件，包括：

FreeSurfer/
IGT/
ITKCommandIO/
MGHImageIO/
MRML/
Qdec/
tclap/
vtkITK/
vtkTeem/
等.....
    除此之外，实际编译中，我还发现需要下列开源库：

Curl: 在命令行方式下工作的开源文件传输工具
Slicerlibcurl：引用Curl库针对Slicer进行的扩展

Freetype: 完全免费（开源）的、高质量的且可移植的字体引擎，它提供统一的接口来访问多种字体格式文件
KWWidgets
    
    2.其中，TCL/TK在Windows平台的编译需要费些功夫，如果不成功的话，可以直接去网上下载已经编译好的。

    3.实际编译过程中，由于使用的VTK版本问题，会出现不兼容的问题，具体找到函数我推测是新的VTK版本对数据结构进行了改变，导致旧版本无法通过编译，我的解决办法是不可取的：使用类似的函数，忽略掉这个错误，主要是错误发生初始化的步骤上，个人感觉应该不影响。有时间的话，应该试一下旧的VTK版本，估计Slicer4不会出现这个问题。

    4.正因为之前我自己编译了其他完整的引用库文件，所以不用在编译Slicer时进行下载工作，网上的说法是这个过程中会下载大量的文件，这里我就忽略了，但是出现的问题是使用CMake时会检测SVN的地址，所以这里需要将CMakeLists.txt文件中的SVN段注释掉。
    此外，文件中Git段也需要注释掉。

    5.小的注意点是，需要特别注意自己VS2008环境的版本，是否是64位版本，在CMake时需要进行选择，不匹配的话会出现一些奇怪的错误。