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测序中常用的术语

2013-12-27 16:04 260 查看
SBS:边合成边测序反应,每次SBS会延伸一个碱基,大约耗时70分钟。

Run:单次上机测序反应,可以产生4G-75G测序通量不等。

Lane:单泳道,每条泳道可以直接物理区分测序样品,1次run最多可以同时上样8条Lane。

Channel:Lane的同义词。

Tile:小区,每条Lane中排有2列tile,合计120个小区。每个小区上分布数目繁多的簇结合位点。

Cluster:簇,在Solexa测序技术中会采用桥式PCR方式生产DNA簇,每个DNA簇才能产生亮度达到CCD可以分辨的荧光点。

Index:标签,在Solexa多重测序(Multiplexed Sequencing)过程中会使用Index来区分样品,并在常规测序完成后,针对Index部分额外进行7个循环的测序,通过Index的识别,可以在1条Lane中区分12种不同的样品。

Barcode: Index同义词

Hiseq 2000 与 2500比较:

2000的通量600G/RUN,2500的通量120G/RUN

2000有2个flowcell,每个flowcell8个lane

2500的也是2个flowcell,快速模式中每个flowcell2个lane,每个lane产出30G数据量

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