centos6.5安装R语言出现问题及解决方法

本着跟上社会发展的节奏，最近想学一学R语言，就在虚拟机装试试，由于自己算是一个linux小白之间产生不少问题，现记录如下。 环境：虚拟机centos6.5 内核为2.6.32-696.1.1.el6.x86_64(这是更新后的内核版本，没更新之前比这个版本低)、R-3.3.2 在网上大多攻略都是先下载R压缩包，然后解压，配置安装，步骤如下： (1)下载安装包 wget https://cran.r-project.org/src/base/R-3/R-3.2.2.tar.gz (2)解决依赖包 #yum install gcc-gfortran #yum install gcc gcc-c++ #yum install readline-devel #yum install libXt-devel (3)解压安装 # tar xvf R-3.3.2.tar.gz # cd R-3.3.2 # ./configure # make # make install 在进行make时，报错make: *** No targets specified and no makefile found. Stop. 这就尴尬了，知道问题来了，找度娘，找到一篇博文，说两个原因，一个是内核太旧，一个是依赖包没装全，就先更新个内核 yum update 更新到一半断掉了，那么问题又来了，重新启动时报错vfs:unable to mount root fs on unknown-block(0,0) 又找度娘，发现是升级时没更新完全，grub引导文件有问题，就到/boot/grub/menu.lst查看，发现最新版本启动命令中缺少initrd，可是天生愚钝，搞不清这个东西是怎么生成的，搞了好久也没搞好，无奈，只能卸掉内核重新更新； yum remove kernel 2.6.32-696.1.1.el6.x86_64 卸载完后，重新yum update，完美升级！删除掉旧内核，升级算是解决了。 然后再解压安装，还是报错，那就是依赖包没装完全，在执行./configure过程中其实就是在检查依赖包，第一次安装时没太注意，后来发现这样一段 checking for zlib.h... yes checking if zlib version >= 1.2.5... no checking whether zlib support suffices... configure: error: zlib library and hea ders are required 再查看内核的zlib rpm -qa | gerp zlib 发现内核自带zlib是1.2.3版本的，可见版本太低造成的，问题确定了，接着度娘，找到一篇博客https://www.hitoy.org/use-the-compiled-zlib-library-to-replace-the-system-integration-one.html 说是要先升级zlib，我想这先卸载，再升级，可是系统不让卸载，后来才发现zlib是内核中很重要的部分，依赖非常多，所以不能卸载；那就直接升级吧，yum install zlib，却告诉我系统已经安装，无奈自己在网上下载个，按照上面博客的说法做下去，最后安装时依旧是找不到zlib！ 这个问题纠结了我两天，没办法换zlib版本，在网上重新下载了个zlib-1.2.5版的 ./configure make make install 上述问题看样子是现有内核版本不支持最新版zlib，所以还是用个低版本的！！ 再安装R又报错bzip2版本太低，要求要大于等于bzip2-1.0.6，内核自带版本是bzip2-1.0.5，网上下载，安装，接着报错 /usr/bin/ld: blocksort.o: relocation R_X86_64_32 against `.rodata.str1.1' can not be used when making a shared object; recompile with -fPIC blocksort.o: could not read symbols: Bad value collect2: ld returned 1 exit status make: *** [all] Error 1 无奈，接着找度娘，需要修改Makefile-libbz2_so中的CC=gcc 为CC=gcc -fPIC，并且解压文件中没有configure，需要先执行 make -f Makefile-libbz2_so，然后在make install； 再次安装R，问题依旧，这就尴尬了，各种百度，都没有解决，问题只能是定位到系统内核本身了，就像第一次安装zlib-1.2.11版本系统不识别一样，看来是系统不兼容bzip2-1.0.6版本，所以这种自己动手安装的办法不可行了，抛弃！ 最后百度了一个只需要三个步骤的方法，大体是说，先更新系统内核，利用第三方yum源epel，其中包含了最新的各种软件包，之后就像安装软件一样利用yum安装R，是成功的，步骤如下： su -c "rpm -Uvh http://download.fedoraproject.org/pub/epel/6/i386/epel-release-6-8.noarch.rpm" yum update yum install R 附图如下： 下载yum源
更新yum源
安装R过程

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