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Spark 小文件合并优化实践

2020-01-11 07:37 726 查看

文章目录

  • 后记
  • 对 spark 任务数据落地(HDFS) 碎片文件过多的问题的优化实践及思考。

    背景

    此文是关于公司在 Delta Lake 上线之前对Spark任务写入数据产生碎片文件优化的一些实践。

    • 形成原因
      数据在流转过程中经历 filter/shuffle 等过程后,开发人员难以评估作业写出的数据量。即使使用了 Spark 提供的AE功能,目前也只能控制 shuffle read 阶段的数据量,写出数据的大小实际还会受压缩算法及格式的影响,因此在任务运行时,对分区的数据评估非常困难。

      shuffle 分区过多过碎,写入性能会较差且生成的小文件会非常多。
    • shuffle 分区过少过大,则写入并发度可能会不够,影响任务运行时间。
  • 不利影响
    在产生大量碎片文件后,任务数据读取的速度会变慢(需要寻找读入大量的文件,如果是机械盘更是需要大量的寻址操作),同时会对 hdfs namenode 内存造成很大的压力。

  • 在这种情况下,只能让业务/开发人员主动的合并下数据或者控制分区数量,提高了用户的学习及使用成本,往往效果还非常不理想。
    既然在运行过程中对最终落地数据的评估如此困难,是否能将该操作放在数据落地后进行?对此我们进行了一些尝试,希望能自动化的解决/缓解此类问题。

    一些尝试

    大致做了这么一些工作:

    1. 修改 Spark FileFormatWriter 源码,数据落盘时,记录相关的 metrics,主要是一些分区/表的记录数量和文件数量信息。
    2. 在发生落盘操作后,会自动触发碎片文件检测,判断是否需要追加合并数据任务。
    3. ​实现一个 MergeTable 语法用于合并表/分区碎片文件,通过系统或者用户直接调用。

    第1和第2点主要是平台化的一些工作,包括监测数据落盘,根据采集的 metrics 信息再判断是否需要进行 MergeTable 操作,下文是关于 MergeTable 的一些细节实现。

    MergeTable

    功能:

    1. 能够指定表或者分区进行合并
    2. 合并分区表但不指定分区,则会递归对所有分区进行检测合并
    3. ​指定了生成的文件数量,就会跳过规则校验,直接按该数量进行合并

    语法:

    merge table [表名] [options (fileCount=合并后文件数量)]  --非分区表
    merge table [表名] PARTITION (分区信息) [options (fileCount=合并后文件数量)] --分区表

    碎片文件校验及合并流程图​:

    性能优化

    对合并操作的性能优化

    1. 只合并碎片文件
      如果设置的碎片阈值是128M,那么只会将该表/分区内小于该阈值的文件进行合并,同时如果碎片文件数量小于一定阈值,将不会触发合并,这里主要考虑的是合并任务存在一定性能开销,因此允许系统中存在一定量的小文件​。

    2. 分区数量及合并方式
      定义了一些规则用于计算输出文件数量及合并方式的选择,获取任务的最大并发度 maxConcurrency 用于计算数据的分块大小,再根据数据碎片文件的总大小选择合并(coalesce/repartition)方式。

        开启 dynamicAllocation
        maxConcurrency = spark.dynamicAllocation.maxExecutors * spark.executor.cores
      • 未开启 dynamicAllocation
        maxConcurrency = spark.executor.instances * spark.executor.cores

      以几个场景为例对比优化前后​的性能:
      场景1:最大并发度100,碎片文件数据100,碎片文件总大小100M,如果使用 coalesce(1),将会只会有1个线程去读/写数据,改为 repartition(1),则会有100个并发读,一个线程顺序写。性能相差100X。

      场景2:最大并发度100,碎片文件数量10000,碎片文件总大小100G,如果使用 repartition(200),将会导致100G的数据发生 shuffle,改为 coalesce(200),则能在保持相同并发的情况下避免 200G数据的IO。

      场景3:最大并发度200,碎片文件数量10000,碎片文件总大小50G,如果使用 coalesce(100),会保存出100个500M文件,但是会浪费一半的计算性能,改为 coalesce(200),合并耗时会下降为原来的50%。

      上述例子的核心都是在充分计算资源的同时避免不必要的IO。

    3. 修复元数据
      因为 merge 操作会修改数据的创建及访问时间,所以在目录替换时需要将元数据信息修改到 merge 前的一个状态,该操作还能避免冷数据扫描的误判。最后还要调用 refresh table 更新表在 spark 中的状态缓存。​

    4. commit 前进行校验
      在最终提交前对数据进行校验,判断合并前后数据量是否发生变化(从数据块元数据中直接获取数量,避免发生IO),存在异常则会进行回滚,放弃合并操作。​

    数据写入后,自动合并效果图:

    后记

    收益
    该同步合并的方式已经在我们的线上稳定运行了1年多,成功的将平均文件大小从150M提升到了270M左右,提高了数据读取速度,与此同时 Namenode 的内存压力也得到了极大缓解。

    ​对 MergeTable 操作做了上述的相关优化后,根据不同的数据场景下,能带来数倍至数十倍的性能提升。

    缺陷
    因为采用的是同步合并的方式,由于没有事务控制,所以在合并过程中数据不可用,这也是我们后来开始引入 D​elta Lake 的一个原因。

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