度分布图引发的折腾

事情的起因，是我要在python3.5中用igraph画网络的度分布图。

读入数据、计算度分布，这些都没问题：

import igraph

g = igraph.Graph.Read("/home/sizheng/hdg/sizheng/myfitness/1/3_1_5000.edges",format="edgelist")
dd = g.degree_distribution()

得到的dd是个柱状图对象，可以直接print出来，但是以文本字符构成的横向的示意，不是真正的图像。查了文档，有个内部的方法__plot__，但无法调用。在邮件列表中提问，回复说用plot调用，于是import matplotlib，不行，又问，回复说不是用matplotlib的，而是igraph里面做了一个plot，于是改成这样：

import igraph
from igraph import plot

g = igraph.Graph.Read("/home/sizheng/hdg/sizheng/myfitness/1/3_1_5000.edges",format="edgelist")

dd = g.degree_distribution()
plot(dd)

还是报错。再问，回答说要用到Cairo包，好吧。。。于是开始被Cairo折磨至今。

Centos自带python2.7，我后装了3.5.1。

按照这里的说法，PyCairo1.10需要Cairo-1.14.6和Python-3.5.2，可是Centos7自带的cairo还不到1.10（这里不禁吐槽一下，Centos的包真心更新慢，Boost、gcc什么的，全都落后官方好几个版本），而cairo-1.14.6又要求libpng-1.6.24和Pixman-0.34.0，毫无悬念地，centos的这两个东西版本又不够高。

于是先下载了libpng-1.6.24和Pixman-0.34.0的源码编译安装，其间遇到找不到freetype某个头文件的情况，原来freetype的头文件目录隐藏在/usr/include/freetype2下，在/usr/include/里建个链接过去搞定。

接着装Cairo-1.14.6，没想到又踩到坑：configure之后的Makefile中居然没找到freetype的库目录，编译参数的-L后面是空的，于是编译时会报错，提示说参数-L和后面的-l之间不应该有空格。OMG，这都什么奇葩问题。这个问题困扰了我好一会儿，后来在Makefile里搜-L发现了，手工编辑Makefile添加上去，OK了。这里得注意不要重新configure，否则又要找不到了。

pycairo没有在pip的包管理中，无奈只能下载源码编译安装，可是问题就出在这里。在编译前的configure阶段，针对python3.5的安装就过不去了：总是在生成的Build.py中报一个无法pickle局部对象的错误：

AttributeError: Can't pickle local object 'Context.__init__.<locals>.node_class'

编辑这个Build.py代码，输出一些相关对象的信息，也看不出什么端倪。在这折腾了很久，无奈转回python2.7试试。

python2.7的cairo包叫py2cairo，下载源码，配置、编译安装，居然挺顺利地通过了！把它的Build.py文件同样输出相关对象信息，跟3.5的也没什么本质区别，实在不明白问题出在哪里。要是有哪位大侠遇到并解决过同样的问题，还望不吝赐教啊~

最后，把python2.7中的igraph卸载重装一下，就能顺利地画出度分布图了。但画出来的图不是双对数坐标，看着有点丑。就不上图了，代码如下，很简单，有兴趣的可以试试：

import cairo
import igraph
from igraph import plot

g = igraph.Graph.Read("/home/sizheng/hdg/sizheng/myfitness/1/3_1_5000.edges",format="edgelist")

dd = g.degree_distribution()
plot(dd)